Manuel Terrazas-López

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14 May 2020 in Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
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NLNaún Lobo-Galo
Naún Lobo-Galo
MTManuel Terrazas-López
Manuel Terrazas-López
AMAlejandro Martinez-Martinez
Alejandro Martinez-Martinez
ADAngel G. Díaz-Sánchez
Angel G. Díaz-Sánchez
Emergent novel SARS-CoV-2 is responsible for the current pandemic outbreak of severe acute respiratory syndrome with high mortality among the symptomatic population worldwide. Given the absence of a current vaccine or specific antiviral treatment, it is urgent to search for FDA-approved drugs that can potentially inhibit essential viral enzymes. The inhibition of 3CLpro has potential medical application, due to the fact that it is required for processing of the first translated replicase polyproteins into a series of native proteins, which are essential for viral replication in the host cell. We employed an in silico approach to test if disulfiram, as well as its metabolites, and captopril could be used as potential antiviral drugs against COVID-19. We provide data on the potential covalent interaction of disulfiram and its metabolites with the substrate binding subsite of 3CLpro and propose a possible mechanism for the irreversible protease inactivation thought the reaction of the aforementioned compounds with the Cys145. Although, captopril is shown to be a potential ligand of 3CLpro, it is not recommended anti-COVID-19 therapy, due to the fact that it can induce the expression of the viral cellular receptor such as, angiotensin-converting enzyme ACE-2, and thus, making the patient potentially more susceptible to infection. On the other hand, disulfiram, an alcoholism-averting drug, has been previously proposed as an antimicrobial and anti-SARS and MERS agent, safe to use even at higher doses with low side effects, it is recommended to be tested for control of SARS-CoV-2 infection.

1 December 2020 in Journal of Molecular Structure
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MTManuel Terrazas-López
Manuel Terrazas-López
NLNaún Lobo-Galo
Naún Lobo-Galo
LALuis Guadalupe Aguirre-Reyes
Luis Guadalupe Aguirre-Reyes
IBIsmael Bustos-Jaimes
Ismael Bustos-Jaimes
JMJorge Ángel Marcos-Víquez
Jorge Ángel Marcos-Víquez
ÁDÁngel Gabriel Díaz-Sánchez
Ángel Gabriel Díaz-Sánchez

1 October 2020 in Biochimie
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MTManuel Terrazas-López
Manuel Terrazas-López
NLNaún Lobo-Galo
Naún Lobo-Galo
LALuis G. Aguirre-Reyes
Luis G. Aguirre-Reyes
JCJorge L. Cuen-Andrade
Jorge L. Cuen-Andrade
LRLaura A. De la Rosa
Laura A. De la Rosa
ADAngel G. Díaz-Sánchez
Angel G. Díaz-Sánchez

18 October 2019 in TIP Revista Especializada en Ciencias Químico-Biológicas
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ADAngel G. Díaz-Sánchez
Angel G. Díaz-Sánchez
MTManuel Terrazas-López
Manuel Terrazas-López
LALuis Guadalupe Aguirre-Reyes
Luis Guadalupe Aguirre-Reyes
NLNaú Lobo-Galo
Naú Lobo-Galo
EÁEmilio Álvarez-Parrilla
Emilio Álvarez-Parrilla
AMAlejandro Martinez-Martinez
Alejandro Martinez-Martinez
La N-Succinil-L, L-diaminopimelato desuccinilasa (DapE) es una amidohidrolasa dependiente de iones de zinc, homodimérica estricta, que cataliza la descomposición del N-succinil-L, L-2,6-diaminopimelato (NSDAP), en succinato y diaminopimelato (DAP). Reacción que constituye la única fuente de meso-diaminopimelato (mDAP) y L-Lys en la mayoría de las bacterias. DapE es esencial para el crecimiento bacteriano y un blanco farmacológico antimicrobiano. El desarrollo de los inhibidores anti-DapE debe tener en cuenta las propiedades dinámicas de la enzima. Se buscan compuestos que interfieran con la formación del agujero del oxianión, en donde participan grupos de ambas subunidades del dímero, que se acomoda en posición catalítica mediante el cambio conformacional de la enzima de un estado abierto a uno cerrado, después de la unión del sustrato; estabilizando a los intermediarios de reacción y produciendo un descenso en la energía de activación. Con base en el análisis cristalográfico y el acoplamiento del sustrato en DapE que se presenta en este trabajo, se discute el papel de la flexibilidad conformacional de la enzima en la hidrólisis del sustrato. Se observa que tanto el grupo carbonilo del sustrato es susceptible al ataque como una molécula de agua ubicada en el sitio activo y se encuentran cercanos a la trayectoria de ataque, en el ángulo de Bürgi-Dunitz.

8 July 2026 in ACS Omega
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MTManuel Terrazas-López
Manuel Terrazas-López
VAVanessa Aitken
Vanessa Aitken
TZTonya N. Zeczycki
Tonya N. Zeczycki
EKEda Koculi
Eda Koculi

25 September 2020
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Conference Paper
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MTManuel Terrazas-López
Manuel Terrazas-López
NLNaun Lobo
Naun Lobo
AMAlejandro Martinez-Martinez
Alejandro Martinez-Martinez
ADAngel G. Díaz-Sánchez
Angel G. Díaz-Sánchez
Infecciones bacterianas multirresistentes acentúan la necesidad de identificar nuevos blancos farmacológicos e inhibidores específicos. Los polifenoles son reconocidos inhibidores de hidrolasas pancreáticas. Se discute el potencial efecto inhibitorio de polifenoles sobre N-succinil-diaminopimelato desuccinilasa (DapE), metalohidrolasa clave para el crecimiento bacteriano. Métodos.