Background/Objectives: Difficulties in emotional regulation are recognized as a risk factor for a variety of emotion-based psychopathologies, including anxiety and depression. In this context, movement and physical activity have been identified as a key element in preventing these health issues, particularly during the initial teacher training. This study aimed to analyze the impact of an emotional health physical education program on the Emotional Intelligence of university students studying physical education in Chile. Methods: A quasi-experimental design with experimental and control groups and repeated measures (pre test-post test) was employed. A total of 214 male and female students from two Chilean universities participated and completed the Spanish version of the Trait Meta-Mood Scale (TMMS-24). Results: Results confirmed the program’s effectiveness in fostering Emotional Intelligence, revealing statistically significant improvements (p < 0.05) in the dimensions of emotional attention and clarity. Conclusions: These findings suggest that emotional physical education programs can be effective in promoting emotional skills essential for the learning and mental well-being of university students who will later become primary and secondary school teachers.

En el presente trabajo se analiza una experiencia didáctica en el marco de la interdisciplinariedad, con base en la educación física en la formación inicial docente. La experiencia se despliega en la asignatura de metodología del fútbol, en estudiantes de tercer año de la carrera de pedagogía en educación física, considerando dos fases. La primera orientada al diseño de una planificación tradicional, mientras que en la segunda fase se plantea un desafío interdisciplinar para el diseño y ejecución de la propuesta didáctica. Entre las dificultades que surgieron en la fase uno, se logra evidenciar que los estudiantes no generan un ambiente motivador para el aprendizaje, situación que mejora considerablemente en la fase dos debido al aporte de la interdisciplinariedad. Finalmente se destacan los aspectos positivos en la utilización de estas didácticas innovadoras que logren desafiar y motivar los estudiantes, logrando así un aprendizaje significativo y permanente en el tiempo.