The pandemic generated by SARS‐Cov‐2 has caused a large number of cases and deaths in the world, but South America has been one of the continents that were most hard hit. The appearance of new variants causes concern because of the possibility that they may evade the protection generated by vaccination campaigns, their greater capacity to be transmitted, or their higher virulence. We analyzed the circulating variants in Peru after improving our Genomic Surveillance program. The results indicate a steep increase of the lambda lineage (C.37) until becoming predominant between January and April 2021, despite the cocirculation of other variants of concern or interest. Lambda lineage deserves close monitoring and could probably become a variant of concern in the near future.
An epizootic of highly pathogenic avian influenza A (H5N1) has spread worldwide since 2022. Even though this virus has been extensively studied for many decades, little is known about its evolution in South America. Here, we describe the sequencing and characterization of 13 H5N1 genomes collected from wild birds, poultry, and wild mammals in Peru during the genomic surveillance of this outbreak. The samples belonged to the highly pathogenic avian influenza (H5N1) 2.3.4.4b clade. Chilean and Peruvian samples clustered in the same group and therefore share a common ancestor. An analysis of the hemagglutinin and neuraminidase genes detected new mutations, some dependent upon the host type. The genomic surveillance of highly pathogenic avian influenza is necessary to promote the One Health policy and to overcome the new problems entailed by climate change, which may alter the habitats of resident and migratory birds.
4 December 2024 in Revista Peruana de Medicina Experimental Y Salud Pública
Objectives. This study aimed to evaluate the prevalence and distribution of dengue virus genotype V serotype 1 (DENV-1) and cosmopolitan genotype serotype 2 (DENV-2) in Peru between 2019 and 2022. Materials and methods. The envelope (E) gene region was amplified from 79 serum samples by polymerase chain reaction (PCR) and sequenced by next-generation sequencing (NGS) technology. The obtained sequences were subsequently analyzed with bioinformatics tools. Results. The study generated envelope gene sequences of DENV-1 and DENV-2 serotypes. Our study revealed a rapid dispersal and wide distribution of the cosmopolitan DENV-2 genotype in several regions of Peru in 2022, as well as the spread of DENV-1 genotype V to new Peruvian regions, along with the cosmopolitan DENV-2 genotype. Conclusions. Our findings suggest the urgent need to strengthen epidemiological and genomic surveillance systems to understand and control the spread of circulating DENV genotypes in Peru. This will allow a more rapid response, as well as the monitoring of its potential dissemination to other countries in the Americas.
Se presenta una descripción detallada de la inflorescencia y flor masculina del género Orthopterygium (A. Gray) Hemsl. en comparación con su género hermano Amphipterygium Standl., ambos anteriormente ubicados en la familia Julianiaceae, con la finalidad de corroborar sus estatus taxonómicos. Se incluyen todas las especies de ambos géneros, O. huaucui, A. molle, A. adstringens, A. simplicifolium y A. glaucum. Se realizaron medidas de las piezas florales (longitud de la flor, longitud y número de sépalos, longitud de las anteras y longitud de los filamentos) así como la longitud de la inflorescencia, éstas fueron sometidas a un análisis de componentes principales. Las estructuras diferenciales más significativas entre ambos géneros corresponden a la longitud y número de sépalos. Esta observación soporta y corrobora los resultados ya reportados por otros autores y constituye el primer avance en el establecimiento del actual estatus taxonómico de Orthopterygium, se sostiene por tanto la consideración de ambos géneros como entidades independientes.
En la Amazonia Peruana los caracoles dulceacuícolas de la familia Ampullariidae son conocidos como churos y originalmente han sido descritas para Perú alrededor de 20 especies. Aunque son muy usadas para alimentación, medicina tradicional y objeto de muchos estudios para su cultivo e industrialización, solamente es mencionada en la literatura la especie Pomacea maculata. Se llevó a cabo la identificación molecular sobre la base del marcador mitocondrial COI, de individuos de churos negros (Pomacea) comercializados en los mercados de Iquitos, así como los usados en platos a la carta en la ciudad de Lima, contrastados con otros individuos de procedencia de su hábitat natural. Se encontró que estos especímenes expendidos corresponden a la especie Pomacea nobilis (Reeve, 1856). El análisis filogenético molecular mostró que P. nobilis es especie hermana de P. guyanensis, en el grupo de P. glauca, distantemente relacionada de P. maculata. Las distancias no corregidas encontradas entre ellas, para el marcador mitocondrial COI, fueron de 11.33% a 13.17%, mientras que con P. maculata fueron de 13.67% a 15.33%. Estos resultados demostraron la eficacia del código de barras de ADN para la identificación y autenticación de la especie, lo que le da un valor agregado para su eventual comercio de exportación.