Coffee stands as a vital pillar of Colombia’s economic prosperity, constituting approximately 7% of the nation’s agricultural GDP. Moreover, it serves as a significant contributor to national agricultural employment, with direct jobs stemming from coffee cultivation comprising 26% of the total agricultural workforce. This underscores the pivotal role coffee plays in shaping Colombia’s social and economic landscape, solidifying its position as the primary origin of mildly washed coffees for global consumers. However, Colombia’s coffee production grapples with the challenge of operating amidst persistently rainy conditions, fostering an environment conducive to fungal diseases. This, compounded by environmental, economic, commercial, and safety constraints for disease control, creates a multifaceted scenario that continuously tests disease management strategies. Addressing this complex dynamic demands a crop protection framework that seamlessly integrates efficient and sustainable methodologies. Such methodologies should prioritize outbreak prevention, cost-effectiveness, adherence to national and international regulations, and the preservation of environmental and human health. Integrated disease management emerges as a solution capable of optimizing productivity tailored to the unique conditions of each plot. By mitigating the impact of pathogens while responsibly utilizing and conserving natural resources, this approach safeguards the well-being of both producers and consumers alike.

Coffee berry disease is caused by Colletotrichum kahawae, a quarantine fungus still absent from most coffee-producing countries. Given the potential adverse effects on coffee berry production, it is a severe worldwide threat to farmers and industry. Current biosecurity management focuses on exclusion by applying quarantine measures, including the certification of coffee plants and their products. However, methods for detecting C. kahawae by National Plant Protection Organization (NPPO) laboratories still need approval. This research aims to functionally demonstrate, standardize, and validate a method for detecting and discriminating C. kahawae from other Colletotrichum species that may be present in coffee plant samples. The method proposes to use an end-point PCR marker for the mating type gene (MAT1-2-1) and a confirmatory test with a real-time quantitative PCR (qPCR) marker developed on the glutamine synthetase gene. The C. kahawae amplicons for the Cen-CkM10 qPCR marker exhibited specific melting temperature values and high-resolution melt profiles that could be readily differentiated from other tested species, including their relatives. Given the fungus’s quarantine status, specificity was tested using artificial mixtures of DNA of C. kahawae with other Colletotrichum species and coffee plant DNA. The described method will enable NPPOs in coffee-producing and exporting countries, especially Colombia, to prevent this pathogen's entry, establishment, and spread. [ ] Copyright © 2024 The Author(s). This is an open access article distributed under the CC BY-NC-ND 4.0 International license .

El propósito de este documento es proporcionar una herramienta para identificar los síntomas asociados a CBD en el campo. La detección temprana de brotes de la enfermedad permitirá una respuesta rápida y efectiva para aplicar medidas cuarentenarias de contención y erradicación de cualquier incursión de CBD en Colombia.

El seminario explora la bacteria Xylella fastidiosa en el cultivo de café en Colombia como una plaga cuarentenaria recientemente detectada, explicando que habita en los vasos del xilema donde obstruye el paso de agua y nutrientes, afectando el desarrollo de la planta. También analiza su transmisión a través de insectos vectores como las chicharritas, que se alimentan del xilema y facilitan su propagación. Se presentan las acciones de control establecidas por el ICA, entre ellas la vigilancia fitosanitaria, la delimitación de zonas afectadas y los protocolos de diagnóstico para contener posibles brotes. Además, se describe la situación actual de la caficultura en el país, señalando que, aunque se han reportado casos en algunos departamentos, aún no representa una limitante grave ni ha generado impactos significativos en la producción. Finalmente, se mencionan estudios, especialmente de Brasil, que evidencian diferencias genéticas entre las variantes que afectan distintos cultivos, lo que sugiere un bajo riesgo de infección cruzada.

Las plagas cuarentenarias son un riesgo latente para la agricultura mundial. El aumento del turismo, las importaciones y exportaciones, tanto formales como informales, junto con los cambios en los procedimientos y las nuevas vías de transporte, incrementan el riesgo de introducción y dispersión de plagas exóticas a nivel mundial. El ingreso de plagas cuarentenarias en los cultivos de café en Colombia puede tener impactos económicos y ecológicos negativos en los agroecosistemas cafeteros. La Disciplina de Fitopatología de Cenicafé trabaja en la identificación y priorización de estos riesgos, así como en el entendimiento del contexto legal, nacional e internacional, que regula el manejo de plagas cuarentenarias. El Instituto Colombiano Agropecuario (ICA) reporta oficialmente siete patógenos como cuarentenarios ausentes para el cultivo del café en Colombia: Colletotrichum kahawae, Gibberella xylarioides, Pseudomonas syringae pv. garcae, Xylella fastidiosa y Coffee ringspot virus. En este seminario se dará a conocer el marco legal que rige el control de plagas cuarentenarias, los riesgos identificados para la caficultura colombiana y las principales acciones involucradas en su manejo. Además, se discutirá el estado actual del conocimiento sobre dos de estos patógenos cuarentenarios: C. kahawae, causante de la enfermedad de las cerezas del café (CBD), y Gibberella xylarioides, responsable del marchitamiento vascular o traqueomicosis de plantas de café.

Este Avance Técnico aborda las limitaciones productivas y fitosanitarias que se presentan cuando no se manejan de forma oportuna y adecuada los grados de sombra requeridos para los sistemas agroforestales con café en Colombia. Entender las interacciones entre los componentes del sistema de producción y los grados de sombra, determinan la necesidad de priorizar el manejo de luminosidad en los sistemas agroforestales con café, como uno de los componentes clave para mantener la rentabilidad de los caficultores colombianos.