Coffee stands as a vital pillar of Colombia’s economic prosperity, constituting approximately 7% of the nation’s agricultural GDP. Moreover, it serves as a significant contributor to national agricultural employment, with direct jobs stemming from coffee cultivation comprising 26% of the total agricultural workforce. This underscores the pivotal role coffee plays in shaping Colombia’s social and economic landscape, solidifying its position as the primary origin of mildly washed coffees for global consumers. However, Colombia’s coffee production grapples with the challenge of operating amidst persistently rainy conditions, fostering an environment conducive to fungal diseases. This, compounded by environmental, economic, commercial, and safety constraints for disease control, creates a multifaceted scenario that continuously tests disease management strategies. Addressing this complex dynamic demands a crop protection framework that seamlessly integrates efficient and sustainable methodologies. Such methodologies should prioritize outbreak prevention, cost-effectiveness, adherence to national and international regulations, and the preservation of environmental and human health. Integrated disease management emerges as a solution capable of optimizing productivity tailored to the unique conditions of each plot. By mitigating the impact of pathogens while responsibly utilizing and conserving natural resources, this approach safeguards the well-being of both producers and consumers alike.

Coffee berry disease is caused by Colletotrichum kahawae, a quarantine fungus still absent from most coffee-producing countries. Given the potential adverse effects on coffee berry production, it is a severe worldwide threat to farmers and industry. Current biosecurity management focuses on exclusion by applying quarantine measures, including the certification of coffee plants and their products. However, methods for detecting C. kahawae by National Plant Protection Organization (NPPO) laboratories still need approval. This research aims to functionally demonstrate, standardize, and validate a method for detecting and discriminating C. kahawae from other Colletotrichum species that may be present in coffee plant samples. The method proposes to use an end-point PCR marker for the mating type gene (MAT1-2-1) and a confirmatory test with a real-time quantitative PCR (qPCR) marker developed on the glutamine synthetase gene. The C. kahawae amplicons for the Cen-CkM10 qPCR marker exhibited specific melting temperature values and high-resolution melt profiles that could be readily differentiated from other tested species, including their relatives. Given the fungus’s quarantine status, specificity was tested using artificial mixtures of DNA of C. kahawae with other Colletotrichum species and coffee plant DNA. The described method will enable NPPOs in coffee-producing and exporting countries, especially Colombia, to prevent this pathogen's entry, establishment, and spread. [ ] Copyright © 2024 The Author(s). This is an open access article distributed under the CC BY-NC-ND 4.0 International license .

El propósito de este documento es proporcionar una herramienta para identificar los síntomas asociados a CBD en el campo. La detección temprana de brotes de la enfermedad permitirá una respuesta rápida y efectiva para aplicar medidas cuarentenarias de contención y erradicación de cualquier incursión de CBD en Colombia.

Las plagas cuarentenarias son un riesgo latente para la agricultura mundial. El aumento del turismo, las importaciones y exportaciones, tanto formales como informales, junto con los cambios en los procedimientos y las nuevas vías de transporte, incrementan el riesgo de introducción y dispersión de plagas exóticas a nivel mundial. El ingreso de plagas cuarentenarias en los cultivos de café en Colombia puede tener impactos económicos y ecológicos negativos en los agroecosistemas cafeteros. La Disciplina de Fitopatología de Cenicafé trabaja en la identificación y priorización de estos riesgos, así como en el entendimiento del contexto legal, nacional e internacional, que regula el manejo de plagas cuarentenarias. El Instituto Colombiano Agropecuario (ICA) reporta oficialmente siete patógenos como cuarentenarios ausentes para el cultivo del café en Colombia: Colletotrichum kahawae, Gibberella xylarioides, Pseudomonas syringae pv. garcae, Xylella fastidiosa y Coffee ringspot virus. En este seminario se dará a conocer el marco legal que rige el control de plagas cuarentenarias, los riesgos identificados para la caficultura colombiana y las principales acciones involucradas en su manejo. Además, se discutirá el estado actual del conocimiento sobre dos de estos patógenos cuarentenarios: C. kahawae, causante de la enfermedad de las cerezas del café (CBD), y Gibberella xylarioides, responsable del marchitamiento vascular o traqueomicosis de plantas de café.

Este Avance Técnico aborda las limitaciones productivas y fitosanitarias que se presentan cuando no se manejan de forma oportuna y adecuada los grados de sombra requeridos para los sistemas agroforestales con café en Colombia. Entender las interacciones entre los componentes del sistema de producción y los grados de sombra, determinan la necesidad de priorizar el manejo de luminosidad en los sistemas agroforestales con café, como uno de los componentes clave para mantener la rentabilidad de los caficultores colombianos.

La enfermedad denominada marchitamiento por Fusarium es una de las más destructivas de los cultivos de plátano y banano en el mundo. Fue inicialmente descrita por Bancroft en Australia (1876) y el hongo causante por Smith (1910). En 1935 Wollenweber y Reinking determinaron que era una variante dentro del hongo Fusarium oxysporum, denominada posteriormente como F. oxysporum f. sp. cubense y de la cual actualmente se conocen cuatro razas fisiológicas (R1, R2, R3 y R4). La R1 destruyó más de 80.000 ha del cultivar de banano Gros Michel en la década de 1950; este se reemplazó por variedades resistentes del subgrupo Cavendish ampliamente cultivadas en la actualidad. En la década de 1990 la resistencia de Cavendish fue vencida por una nueva variante denominada Raza 4 tropical (R4T) en Taiwán; de allí se ha diseminado poniendo en riesgo la producción mundial de plátano y banano. El 8 de agosto de 2019, el Instituto Colombiano Agropercuario (ICA) confirmó la presencia de la R4T en cultivos de banano en el departamento de La Guajira en Colombia, e inició el plan de contingencia que incluyó entre otras actividades, la erradicación de 168 ha de banano en el área de detección, restricciones al movimiento de material vegetal de musáceas en esta región y la vigilancia epidemiológica en el departamento y demás áreas productoras de plátano y banano en Colombia. Este seminario tiene por objetivo presentar algunas características de la biología del hongo y la epidemiología de la enfermedad que permitan entender los factores que determinan su ocurrencia y por qué representa un alto riesgo para la producción y la seguridad alimentaria mundial y nacional, incluyendo las zonas cafeteras de Colombia. Esta misma información se utilizó en un programa de capacitación para productores de plátano y banano de 25 departamentos en Colombia realizada por Cenicafé en convenio entre la FNC y el ICA en el año 2019.