В статье приведены результаты исследования по определению биологических и хозяйственных эффективности фунгицидов на семенную инфекцию льна в лабораторных и полевых условиях. За период проведения исследований в лабораторных условиях разработано и испытано более 20 различных защитно-стимулирующих составов. Для полевых испытаний из них были отобраны 7 составов для обработки семян, положительно влияющих на качество посева семян, а также подавляющих патогенную микрофлору льна. Полевые эксперименты проводились на опытных полях ТОО "Байсерке-Агро", расположенных в Талгарском районе Алматинской области. Проведена фитоэкспертиза семян льна и подобраны защитно-стимулирующие составы для их оздоровления. В результате исследований было установлено, что все испытанные варианты отличились высокой лабораторной всхожестью от 85,0 до 98,0%, биологическая эффективность против плесневения семян составила в пределах 40,5–100%. Также оценено влияние защитно-стимулирующих составов на полевую всхожесть семян льна. Наибольшая густота всходов была в варианте ТМТД, в.с.к. – 5,0 л/т т + Селест –топ, 312,5 к.с. 1,0 л/т + Экстрасол 1,0 л/т этот показатель достигал до 95,5, в контрольном варианте – 73,1%. Кроме того, отобранные варианты показали высокую биологическую эффективность против корневой гнили в фазу елочки – 60,7–96,4 %, перед уборкой – 59,1–93,8%.