Inflammation is a complex reaction involving cellular and molecular components and an unspecific response to a specific aggression. The use of scientific and technological innovations as a research tool combining multidisciplinary knowledge in informatics, biotechnology, chemistry and biology are essential for optimizing time and reducing costs in the drug design. Thus, the integration of these in silico techniques makes it possible to search for new anti-inflammatory drugs with better pharmacokinetic and toxicological profiles compared to commercially used drugs. This in silico study evaluated the anti-inflammatory potential of two benzoylpropionic acid derivatives (MBPA and DHBPA) using molecular docking and their thermodynamic profiles by molecular dynamics, in addition to predicting oral bioavailability, bioactivity and toxicity. In accordance to our predictions the derivatives proposed here had the potential capacity for COX-2 inhibition in the human and mice enzyme, due to containing similar interactions with the control compound (ibuprofen). Ibuprofen showed toxic predictions of hepatotoxicity (in human, mouse and rat; toxicophoric group 2-arylacetic or 3-arylpropionic acid) and irritation of the gastrointestinal tract (in human, mouse and rat; toxicophoric group alpha-substituted propionic acid or ester) confirming the literature data, as well as the efficiency of the DEREK 10.0.2 program. Moreover, the proposed compounds are predicted to have a good oral bioavailability profile and low toxicity (LD50 < 700 mg/kg) and safety when compared to the commercial compound. Therefore, future studies are necessary to confirm the anti-inflammatory potential of these compounds.
28 June 2021 in Journal of Computer-Aided Molecular Design
The visceral form of Leishmaniasis, also known as kala-azar, caused by Leishmania chagasi is the main etiological agent of this form in Brazil responsible for 30,000 annual deaths. Despite its epidemiological impact, treatment of the disease is limited by resistance, species-dependent efficacy and serious adverse effects. The application of computational tools to prioritize potential bioactive molecules based on 3D structural of biological target is a viable alternative. Among the L. chagasi validated targets, Fe + 2 superoxide dismutase B2 (LcFeSODB2) is the first parasite enzyme against oxidative stress and it is involved in essential metabolic processes for its survival. Due to substrate binding-site volume (superoxide ion) and consequent difficulty in its active site modulation for small molecules, the search for allosteric sites at LcFeSODB2 3D structure is a promising strategy. As there are no 3D structures of LcFeSODB2, comparative modeling was applied to build 3D models by SWISS-MODEL and MODELLER version 9.19. Next, the best 3D model was used in molecular dynamics (MD) routines with multiple probes on GROMACS version 5.1.2. In addition, potential allosteric sites predicted by FTMap and Metapocket web servers were used with probe occupancy maps from MD to select an allosteric binding site and propose a pharmacophore model. Next, it was used as a template in virtual screening by UNITY® module available on SYBYL-X version 2.1.1 at Sigma-Aldrich CPR™ subset of ZINC12 database. The pharmacophore-based virtual screening resulted in the selection of two potential allosteric LcFeSOD compounds with partial pharmacophoric requirements, drug-like properties and commercial availability for enzymatic assays. Communicated by Ramaswamy H. Sarma
Este artigo analisa as EtnoMatemaTicas investigadas na Região Nordeste do Brasil, evidenciadas nos Anais do Sétimo Congresso Brasileiro de Etnomatemática (CBEm7). A partir de uma pesquisa documental, os dados nacionais foram analisados quantitativamente pelas linguagens de programação Python e R, e os dados regionais, qualitativamente por descrição. Como pesquisa sobre pesquisas, caracteriza-se como uma metapesquisa de abordagem quanti-qualitativa. Os elementos presentes nas 14 pesquisas analisadas qualitativamente permitiram identificar que as EtnoMatemaTicas nordestinas se voltam principalmente aos conhecimentos de grupos socioculturalmente identificáveis com vista à promoção de um ensino de Matemática contextualizado; suscitam discussões decoloniais e sociopoliticoculturais e estratégias de ações na Educação (Matemática). E os elementos das 153 pesquisas nacionais reforçaram a Educação Matemática como termo regional e nacionalmente de maior importância e mostram expressiva participação das instituições nordestinas. Os resultados conferem valor à pesquisa em Etnomatemática e apontam suas principais direções e seus possíveis impactos pedagógicos.
1 January 2025 in Bolema: Boletim de Educação Matemática
Resumo Para atenuar a mesmice das práticas educacionais em matemática, e suprir uma demanda contemporânea, este estudo integra a programação de computadores e a Etnomatemática numa abordagem inovadora, apresentando-as como epistemologias amigáveis capazes de conectar conhecimentos matemáticos às realidades diversas, na Educação Básica e na formação de professores. Partindo do pensamento computacional e embasado em discussões sobre os currículos escolares vigentes e sobre cognição (biológica e artificial), estabelece como questão da pesquisa: como considerar o pensamento computacional e a programação na Educação (Matemática) a partir da Etnomatemática? Nesse sentido, o objetivo geral é demonstrar, a partir do Programa Etnomatemática, como o pensamento computacional e a programação podem ser considerados na Educação (Matemática). Com a programação conceituada como uma forma de Etnomatemática, metodologicamente, foram elaborados exemplos de recursos pedagógicos sobre aritmética, probabilidade, biologia, música e cognição. Os exemplos em Python priorizam a acessibilidade para iniciantes, promovendo o pensamento matemático e computacional de maneira integrada ao materializar diálogos transdisciplinares. Os resultados sugerem uma Educação mais crítica e reflexiva, pois trazem algumas situações sociais relevantes, flexíveis e adaptáveis, e levam a concluir que o estudo é contributivo ao uso consciente de conhecimentos matemáticos no exercício da cidadania.