Background: Breast cancer (BC) is the most common cancer and the leading cause of cancer death in women. Hereditary BC risk accounts for 25% of all cases. Pathological variants in known BC precursor genes explain only about 30% of hereditary BC cases, while the underlying genetic factors in most families remain unknown. Identifying hereditary cancer risk factors will help improve genetic counseling, cancer prevention, and cancer care. Methods: Here, we used whole-exome sequencing (WES) to identify genetic variants in 105 Vietnamese patients with BC and 50 healthy women. BC-associated variants were screened by the Franklin software and the criteria of the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) and evaluated based on in silico analysis. Results: In total, 56 variants were identified in 37 genes associated with BC, including ACVR1B, APC, AR, ARFGEF1, ATM, ATR, BARD1, BLM, BRCA1, BRCA2, CASP8, CASR, CHD8, CTNNB1, ESR1, FAN1, FGFR2, HMMR, KLLN, LZTR1, MCPH1, MLH1, MSH2, MSH3, MSH6, NF1, PMS2, PRKN, RAD54L, RB1CC1, RECQL, SLC22A18, SLX4, SPTBN1, TP53, WRN, and XRCC3 in 41 patients. Among them, 12 variants were novel, and 10 variants were assessed as pathogenic/likely pathogenic by ACMG and ClinVar. Variants of uncertain significance (VUS) were evaluated using in silico prediction software to predict whether they are likely to cause the disease in patients. Conclusions: This is the first WES study to identify BC-associated genetic variants in Vietnamese patients, providing a comprehensive database of BC susceptibility gene variants. We suggest using WES as a tool to identify genetic variants in BC patients for risk prediction and treatment guidance.

Objectives: Detecting and diagnosing Lynch syndrome in colorectal cancer patients is essential for enhancing the quality of diagnosis, treatment, and management. This study aims to characterize mismatch repair (MMR) protein expression and MMR gene variants in Vietnamese patients. Methods: A total of 218 patients diagnosed with colorectal cancer at the Nuclear Medicine and Oncology Center, Bach Mai Hospital (Hanoi, Vietnam) were included in this descriptive, retrospective study. Tumor tissue samples were evaluated for MMR protein expression. Cases with loss of MMR protein expression underwent genomic sequencing for MMR gene mutations. Results: Among 218 colorectal cancer patients, 135 were men (61.9 %) and 83 were women (38.1 %), aged 16–86 years. The prevalence of MMR deficiency (dMMR) was 14.7 %. The expression loss rates of the MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, MLH1/PMS2, and MSH2/MSH6 proteins were 9.4 %, 3.1 %, 3.1 %, 21.9 %, 46.9 %, and 15.6 %, respectively. Within the dMMR group, four variants were identified in the MLH1 gene, one in the MSH2 gene, two in the PMS2 gene, and one in the EPCAM gene, and all were classified as germline pathogenic variants associated with Lynch syndrome. Conclusion: This is a study to apply next-generation sequencing (NGS) technology to diagnose Lynch syndrome from dMMR cases in Vietnamese colorectal cancer patients. Our research supports the screening and diagnosis of Lynch syndrome through testing using MMR protein expression and assessing pathogenic variants in MMR genes.

Hội chứng Lynch là một rối loạn di truyền làm tăng nguy cơ mắc các loại ung thư, đặc biệt là ung thư đại trực tràng, nội mạc tử cung và một số loại ung thư khác. Nguyên nhân chủ yếu do mang các biến thể gây bệnh gen sửa chữa bắt cặp sai DNA (gen MMR) gồm MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 và EPCAM. Việc phát hiện các trường hợp mắc hội chứng Lynch có ý nghĩa quan trọng trong sàng lọc, tư vấn di truyền và dự phòng ung thư cho bệnh nhân và người thân trong gia đình. Nghiên cứu mô tả 8 trường hợp người bệnh được chẩn đoán mắc hội chứng Lynch thông qua xét nghiệm di truyền phát hiện biến thể gây bệnh trên các gen MMR. Trong 8 trường hợp, các gen đột biến được xác định bao gồm: MLH1: 4 trường hợp, MSH2: 1 trường hợp, PMS2: 2 trường hợp và EPCAM: 1 trường hợp. Cả 8 người bệnh đều có ít nhất 1 người thân thế hệ thứ nhất hoặc thứ hai mắc ung thư hoặc tử vong sớm do bệnh. Đặc điểm về phả hệ cho thấy sự lặp lại ung thư qua các thế hệ trong các gia đình hoặc nhiều người được chẩn đoán mắc ung thư. Hội chứng Lynch có biểu hiện rõ ràng qua tiền sử ung thư gia đình và được xác định thông qua xét nghiệm gen MMR. Việc phát hiện sớm các trường hợp mang đột biến MMR giúp can thiệp kịp thời, nâng cao hiệu quả điều trị và tầm soát ung thư cho người bệnh cũng như thân nhân. Khuyến nghị cần mở rộng xét nghiệm di truyền cho các thành viên trong gia đình bệnh nhân để phòng ngừa và phát hiện sớm ung thư.