Recently, new carbapenemases in Enterobacteriaceae strains and non-fermentative gram-negative bacilli have been reported. The New Delhi metallo‐β‐lactamase-1 (NDM-1) is a major problem around the world. The purpose of this article is to address the NDM-1 Klebsiella pneumoniae epidemic detected in eight cases in our hospital. Bacteria identified in this epidemic were from patients already admitted to the intensive care unit of the Sakarya University Training and Research Hospital during efforts toward establishment of infection surveillance and control program. Antimicrobial susceptibility testing of strains was performed using the VITEK 2 system (bioMérieux, France), E-test gradient strips (bioMérieux, France), and the disc diffusion test. For the metallo-beta-lactamase activity, the combined disc diffusion test and modified Hodge test as phenotypic tests were performed. To identify the resistance gene, the Xpert Carba-R kit (Cepheid Inc., USA) and an in-house multiplex polymerase chain reaction (PCR) method designed for five common carbapenemase genes (IMP, VIM, KPC, NDM-1, and OXA-48) were employed. The clonal relationship of these strains was explored by the repetitive PCR (rep-PCR, DiversiLab System, bioMérieux, France) method. During the December 2014 to March 2015 period, NDM-1 positive K. pneumoniae strains were detected in eight patients. All of these strains were found to produce NDM-1, while two of them also revealed the presence of OXA‐48. The rep-PCR results reveal a clonal proximity of 95 % for six of the eight strains. Our findings suggest the tendency of NDM-1-producing strains to spread in our country as well. A carbapenem-resistant K. pneumoniae threat may pose a great risk to our country. It is clear that more comprehensive infection control precautions should be implemented in our hospitals.

The vast majority of patients who hospitalized with coronavirus disease 2019 are given empirical antibiotic therapy. However, information on the frequency, microorganism species, and resistance rates of secondary bacterial infections in coronavirus disease 2019 patients are insufficient. We aimed to show the frequency of secondary infections and resistance conditions in patients with coronavirus disease 2019 hospitalized in the intensive care unit. The results of tracheal aspirate culture, blood culture, and urine culture obtained from coronavirus disease 2019 patients - at least 2 days after their admission to the intensive care unit - were examined microbiologically. A total of 514 patients hospitalized in intensive care unit were included in our study. Tracheal aspirate, blood, or urine cultures were collected from 369 patients (71.8%). Bacterial reproduction was detected in at least one sample in 171 (33.3%) of all patients. The rate of respiratory tract infection and/or bloodstream infection was found to be 21%. Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae, and Pseudomonas aeruginosa in tracheal aspirate culture; Coagulase-negative staphylococci, K. pneumoniae, and A. baumannii in blood culture; and Escherichia coli, K. pneumoniae, and Enterococcus faecalis in urine culture were the most common microorganisms. A. baumannii was resistant to most antibiotics except colistin and P. aeruginosa strains were resistant to most antibiotics except amikacin, colistin, cefepime, and imipenem. In K. pneumoniae, the highest meropenem sensitivity (73%) was observed; there was a strong resistance to most of the remaining antibiotics. We think that our study can be useful in choosing empirical antibiotic therapy in the coronavirus disease 2019 pandemic and reducing the mortality that may occur with secondary infection.

Tüberkülozda ilaç direnç sürveyansının yapılması tüberküloz kontrol ve tedavi programlarının temelini oluşturur. Bu çalışmada, laboratuvarımızda izole edilen M. tuberculosis kompleksi izolatlarının primer antitüberküloz ilaçlara duyarlılıklarının araştırılması ve direnç paternlerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmada, 2012-2017 yılları arasında tüberküloz şüphesi ile laboratuvarımıza gönderilen 11194 klinik örnek değerlendirmeye alınmıştır. Tüberküloz kültürü ve duyarlılık testleri BACTEC MGIT 960 (Becton Dickinson, ABD) sistemi ile, üretici firmanın önerileri doğrultusunda gerçekleştirilmiştir. Çalışmaya alınan örneklerden M. tuberculosis kompleks olarak tanımlananan 466 (%4,1) örneğe antibiyotik duyarlılık testi uygulanmıştır. Klinik örneklerde M. tuberculosis kompleks pozitifliği, 2012-2017 yılları arasında sırasıyla; %4,5, %3,4, %3,5, %4,6, %5,4 ve %3,1 bulunmuştur. İzole edilen M. tuberculosis kompleksi izolatları, 2012-2017 yılları arasında sırasıyla %66,2, %90,7, %81,4, %78, %80, %74 oranında tüm primer ilaçlara duyarlı bulunmuştur. En az bir antitüberküloz ilaca direnç oranı %14,8 olarak bulunmuştur. Çok ilaca direnç ise %4,1oranında bulunmuştur. Çoklu direnç daha çok 2012 yılında saptanmıştır. TB dışı mikobakteri saptama oranı ise %0,4 olarak bulunmuştur. Tüberkülozda direnç paternlerinin izlenmesi, uygulanacak tedavi protokollerinin belirlenmesinde önemli olduğu gibi uzun vadede direnç gelişiminin önlenmesinde de yararlı olacaktır.

Introduction: In recent years, the rapid spread of carbapenem-resistant K. pneumoniae, their higher mortality rates, and limited treatment alternatives cause difficulties in the treatment of these infections. New treatment alternatives are needed to cope with resistant strains. In recent years, natural products such as Quercetin have started to be preferred in combination studies due to their antimicrobial effects and low side-effect profiles. The aim of this study was to investigate the in vitro efficacy of the combination of Quercetin and Meropenem on carbapenemase-producing (blaKPC, blaNDM, blaVIM, blaOXA-48, and blaIMP), carbapenem-resistant K.pneumoniae isolates using the checkerboard method. Methodology: Thirty Carbapenem-resistant K.pneumoniae strains in the culture collection of our laboratory were included in our study. Carbapenemase genes were determined using the Xpert® Carba-R (Cepheid, USA). Synergism with meropenem was assessed by checkerboard analysis, followed by FIC index, and combination index calculation. Results: Twenty (66.6%) strains had OXA-48, 6 (20%) NDM, 1 (3.3%) KPC, 1 (3.3%) OXA-48+NDM genes, and 2 strains (6.6%) gene could not be detected. In the Quercetin and Meropenem combination study, synergy was found in 24 (80%) of the strains; an additive effect was found in 5 (16.6%) and an antagonist effect in 1 (3.3%). In 19 (63.3%) of the strains, meropenem MIC values were below the sensitive limit (MIC ≤ 2 μg/mL). Conclusions: Although the combination of quercetin and meropenem has a high synergistic effect in carbapenem-resistant K. pneumoniae isolates, it seems that the carbapenemase species affects this situation. however, more work is needed on this subject.

Piperasilin-tazobaktam (TZP), genişletilmiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üreten Gram-negatif bakterilerin neden olduğu enfeksiyonların tedavisi için sıklıkla tercih edilen bir ajandır. Bununla birlikte, GSBL üreten bakterilerin neden olduğu ciddi enfeksiyonlara Piperasilin-tazobaktamın etkinliği hakkında tartışmalar vardır. Bu çalışmada, laboratuvara gönderilen örneklerden izole edilen GSBL pozitif bakterilerde TZP'nin etkinliğini belirlemeyi amaçladık. Servis ve poliklinik hastalarına ait kan, idrar, yara, trakeal aspirat örneklerinden izole edilen 548 GSBL pozitif Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşu çalışmaya dahil edildi. Bakteri tanımlaması, antibiyotik duyarlılık testleri ve GSBL tespitinde VİTEK 2® otomatize sistemi kullanıldı. Çalışmamıza dahil edilen izolatların 307’si (%56) E. coli, 241’i (%43,9) K. pneumoniae suşu idi. İzolatların TZP direnç oranları incelendiğinde; E. coli suşlarında TZP direnç oranı %44,6 olarak saptanırken en yüksek direnç %47,6 ile trakeal aspirat örneklerinde saptandı. K. peumoniae suşlarında ise TZP direnç oranı %41 olarak bulundu. GSBL pozitif bakterilerin neden olduğu enfeksiyonlarda TZP'nin etkinliğini gösteren yeterli çalışma bulunmamakla birlikte, mevcut çalışmalar bu antibiyotiklerin etkinliğinin enfeksiyon bölgesine ve şiddetine göre değiştiğini göstermektedir. PRP sonuç bildirimi ile ilgili CLSI ve EUCAST arasında bir fikir birliği yoktur. Bu nedenle, bu konuda daha kapsamlı bir çalışmaya ve TZP'nin sonuç raporunun yeniden değerlendirilmesine ihtiyaç vardır.