The objective of this study was to characterize horticultural farms in Cerro Punta, Highlands– Chiriqui; about socioeconomic and agri-environmental aspects, with emphasis on the pesticides used, Panama. About 31 farms were randomly selected and producers were surveyed. In addition, a random soil sampling was carried out in five locations, to proceed with the physical-chemical analysis and pesticide residues analysis, such as organophosphates, carbamates, pyrethroids and organochlorines. According to the results, 48% of those surveyed are between 41 and 55 years old, with education at the primary level in 39% of cases and 55% belong to farmers associations. The five main crops are potatoes, carrots, cabbage, lettuce and onion and 26% carry out animal husbandry. The production costs were variable, from less than USD 3500 to more than USD 14 000 per hectare per year; the yield ranged from 3.68 t. ha-1 to 52.62 t. ha-1; associated with the implemented technologies. About 77% of the producers use untreated chicken manure and 36 different pesticides are used in the area. The 52% of the farmers use complete personal protective equipment. Regarding the laboratory analysis, the soils have a loamy-sandy texture, with a pH between 5.7 and 6.5, organic matter content between 1.34% and 4.34% and the Effective Cation Exchange Capacity between 8.04 and 26.75.

Soil, rhizosphere, and plant-associated microorganisms can enhance plant growth and health. A genomic analysis of these microbes revealed the key characteristics contributing to their beneficial effects. Following a field survey in Panama, four bacterial isolates with plant growth-promoting traits (PGPT) in rice (Oryza sativa L.) were identified. In this study, we sequenced, assembled, and annotated the genomes of Lysinibacillus fusiformis C6 and 24, and Bacillus cereus D23 and 59. The C6 genome was 4,754,472 bp long with 10 contigs, 37.62% guanine-cytosine (GC) content, and 4657 coding sequences (CDS). The 24 genome was 4,683,219 bp with five contigs, 37.65% GC content, and 4550 CDS. The D23 genome was 6,199,908 bp long with 18 contigs, 34.84% GC content, and 6141 CDS. The 59 genome was 6,194,462 bp with 21 contigs, 34.87% GC content, and 6122 CDS. Digital DNA–DNA hybridization (dDDH) and average nucleotide identity (ANI) confirmed that C6 and 24 belong to Lysinibacillus fusiformis, whereas D23 and 59 belong to the Bacillus cereus species. Further results revealed that these bacteria contained genes characteristic of plant growth-promoting bacteria, such as siderophore, phytohormone auxin (IAA) production, and nitrogen-fixing abilities that promote plant growth. Moreover, the antiSMASH database identified gene clusters involved in secondary metabolite production (biosynthetic gene clusters), such as betalactone, NRPS-like, NRP-siderophore, terpene, and RiPP-like clusters. Moreover, diverse and novel biosynthetic clusters (BCGs) have included non-ribosomal peptides (NRPs), polyketides (PKs), bacteriocins, and ribosomally synthesized and post-transcriptionally modified peptides (RiPPs). This work offers new insights into the genomic basis of the studied strains’ plant growth-promoting capabilities.

Sampling of the rice phyllosphere was carried out in a plot under the modality of organic subsistence agriculture, located in the community of Los Alvéos, province of Coclé, Republic of Panama. Subsequently, isolation of fungi from the rice phyllosphere, in vitro confrontation tests and identification of microorganisms (fungi) with antagonistic potential against the phytopathogen Pyricularia oryzae, which causes the disease known as panicle blight (pyriculariosis), were carried out. A total of 68 endophytic fungal strains were isolated from the phyllosphere (20 from the apical section, 22 from the middle section and 26 from the basal section), of which 29 showed positive antagonism (PCIR ?40%) against the phytopathogen P. oryzae, corresponding to the genera Aspergillus, Penicillium, Trichoderma and Fusarium (they were identified molecularly by amplifying the ITS gen and sequencing them). The objective of this research was to isolate and characterize fungi with antagonistic biological activity against p. oryzae. Se realizaron muestreos de la filósfera de arroz, en una parcela bajo la modalidad de agricultura orgánica de subsistencia, ubicada en la comunidad de Los Alvéos, provincia de Coclé, República de Panamá. Posteriormente, se efectuaron aislamientos de hongos de la filósfera del arroz, pruebas de enfrentamiento in vitro e identificación de los microorganismos (hongos) con potencial antagónico frente al fitopatógeno Pyricularia oryzae, causante de la enfermedad conocida como tizón de la panícula (pyriculariosis). Se aislaron un total de 68 cepas fúngicas endófitas de la filósfera (20 de la sección apical, 22 de la sección media y 26 de la sección basal), de las cuales 29 mostraron antagonismo positivo (PCIR ?40%) ante el fitopatógeno P. oryzae, correspondiendo a los géneros Aspergillus, Penicillium, Trichoderma y Fusarium (se identificaron molecularmente amplificando el gen ITS y secuenciándolos). El objetivo de esta investigación fue aislar y caracterizar hongos con actividad biológica antagónica contra p. oryzae.

El objetivo de esta investigación fue identificar taxonómicamente la diversidad de hongos encontrados en anuros a través de hisopados dérmicos. El trabajo se realizó en el distrito de Antón, provincia de Coclé, Panamá. En primera instancia, se realizó el muestreo en áreas boscosas del valle de Antón. Para esto, se seleccionaron tres sitios de estudio: Monumento Natural Cerro Gaital (CG), Área boscosa del Hotel Campestre (HC) y Centro de Conservación de Anfibios del Valle Antón (CC). Mediante la técnica de hisopado de muestreo la parte ventral (extremidades anteriores y posteriores) del anuro, obteniendo un total de 150 muestras, las cuales fueron llevadas al Laboratorio de Microbiología del Centro Regional Universitario de Coclé. Las muestras se sembraron en Agar Papa Dextrosa con adición de Penicilina (0.1g/mL) y se incubaron a temperatura ambiente (28-32°C). Los morfotipos obtenidos se clasificaron siguiendo las claves de Moller et al., (1995). Los resultados indican que el porcentaje de especímenes capturados por las técnicas de muestreo en los dos sitios de vida libre (CG y HC) presentan una diferencia significativa (?2²= 7.76; p=0.02) con respecto al Centro de Conservación, siendo Dendrobatidae y Strabomantidae las familias más importantes. La prueba de T de Hutchinson aplicada a los morfotipos de los tres sitios indica diferencias en la diversidad de los sitios. CG (H´= 1.633 ± 0.010), CC (H´= 1.303 ± 0.009), siendo el primero el que presenta mayor diversidad (t= 2.28, g.l.= 178.35, p= 0.02). Se registró también diferencias en la diversidad de HC (H´= 1.663 ± 0.0154) y CC (H´= 1.303 ± 0.0086), donde HC presenta mayor diversidad (t= -2.01, g.l.= 83.36, p=0.04). No se encontró diferencias en la diversidad entre los sitios CG (t= 0.016, g.l.= 91.45, p=0.98). La especie Aspergillus flavus fue la única presente en los tres sitios.

The present investigation was carried out in Rio Hato, Coclé province, with the objective of isolating and identifying microorganisms with antagonistic activity against the fungal pathogen Thanetophorus cucumeris (Rhizoctonia solani) in bean plants (Phaseolus vulgaris), to minimize the use of fungicides and other chemical compounds used in the conventional control of this fungus. A total of 185 bacteria and 72 fungi were isolated from bean plants in their three phenological stages (vegetative, flowering and fruiting) within the rhizosphere and phyllosphere. It was determined that there were significant differences between the dilutions used, being the 10-4 dilution where the greatest number of bacteria were isolated. In relation to the epiphytic organisms, there were significant differences between the dilutions, being the 10-4 dilution where more bacteria were isolated, no differences were determined between the phenological phases. The vegetative phase presented the largest number of isolates; there were no differences for the sections of the phyllosphere. Regarding the epiphytic fungi, there were no statistical differences between the dilutions or in the phenological phases. In the endophytic section, the fruiting phase presented most of the fungal isolates. In relation to the rhizosphere fungi, significant differences were determined in the dilutions, being 10-4 where more isolates were obtained. Finally, it was possible to isolate seven bacteria and four positive fungi with antagonistic biological activity against the pathogen T. cucumeris. La presente investigación se realizó en Rio Hato, provincia de Coclé, con el objetivo de aislar e identificar microorganismos con actividad antagonista contra el patógeno fúngico Thanetophorus cucumeris (Rhizoctonia solani) en plantas de frijol (Phaseolus vulgaris), a fin de minimizar el uso de fungicidas y otros compuestos químicos utilizados en el control convencional de este hongo. Se aislaron un total de 185 bacterias y 72 hongos a partir de plantas de frijol en sus tres estados fenológicos (vegetativo, floración y fructificación) dentro de la rizósfera y filósfera. Se determinó que hubo diferencias significativas entre las diluciones utilizadas, siendo la dilución de 10-4 donde se aislaron mayor cantidad de bacterias. En relación con los organismos epífitos hubo diferencias significativas entre las diluciones, siendo la dilución 10-4 donde más bacterias se aislaron, no se determinaron diferencias entre las fases fenológicas. La fase vegetativa presentó la mayor cantidad de aislamientos; no existieron diferencias para las secciones de la filósfera. En cuanto a los hongos epifíticos no hubo diferencias estadísticas entre las diluciones ni en las fases fenológicas. En la sección endófita, la fase de fructificación presentó la mayoría de los aislamientos fúngicos. En relación con los hongos de la rizósfera se determinaron diferencias significativas en las diluciones, siendo 10-4 donde más aislamientos se obtuvo. Finalmente, se lograron aislar siete bacterias y cuatro hongos positivos con actividad biológica antagonista contra el patógeno T. cucumeris.

Las actividades agropecuarias tienen el desafío de alimentar a la población en crecimiento, sin comprometer los recursos de las generaciones venideras. Mundialmente la ganadería representa el 40% de la producción total, por lo que se buscan estrategias que aumenten su rendimiento, en ese sentido el uso de pastos mejorados en la alimentación del ganado representa una alternativa para el aumento de peso. El objetivo de esta investigación fue evaluar el uso de un formulado de microorganismos fijadores no simbióticos de nitrógeno en la producción del pasto Cynodon dactylon (L.Pers 1805, Poales,Poaceae). El producto utilizado fue Bacter Crecimiento® desarrollado por Agrobiológicos de Panamá (ABP, S.A.). El sitio de estudió se ubicó en el poblado de Sardina, Corregimiento y Distrito de Penonomé, provincia de Coclé. Se midieron tres parcelas de 40 m2 dentro de un área de una hectárea ya sembrada con el pasto Cynodon dactylon. Se aplicaron 3 tratamientos: Fertilización con Bacter Crecimiento, abono convencional y testigo absoluto. En el primer día se realizó un corte de nivelación y una vez completado el ciclo de crecimiento de la pastura se procedió a estimar el rendimiento de forraje en términos de kg de MS/ha. Los resultados obtenidos indican una similitud de rendimiento entre la parcela fertilizada con el producto biológico y la parcela con fertilización química