Linezolid (LNZ) is a synthetic oxazolidinone antibiotic that inhibits bacterial protein synthesis through binding to ribosomal RNA, also preventing the assembly of the initiation complex during translation. It is one of the last-line therapeutic options for serious infections caused by problematic Gram-positive pathogens, including vancomycin-resistant and multidrug-resistant Enterococcus species. Data from recent large-scale studies show a 2.5-fold increase in the prevalence of clinical LNZ-resistant enterococci (LRE) over the past decade with a global detection rate of 1.1% for LNZ-resistant E. faecium (LREfm) and 2.2% for LNZ-resistant E. faecalis (LREfs). Most reported cases have originated from China, followed by South Korea and the United States. LREfm typically belongs to the high-risk clonal complex 17, whereas LREfs demonstrates a heterogeneous population structure. Mutations in the 23S rRNA and ribosomal proteins, as well as acquired resistance genes such as cfr, optrA, and poxtA are involved in the development of LNZ resistance among enterococci. Whole-genome sequencing (WGS) has been recognized as a gold standard for identifying the underlying molecular mechanisms. It exposes that numerous LRE isolates possess multiple LNZ resistance determinants and mutations, further complicating the treatment strategies. The present review article summarizes all known mutational and non-mutational LNZ resistance mechanisms and presents a global overview of WGS-based studies with emphasis on resistome analysis of clinical LREfs and LREfm isolates published in the literature during the period 2014–2025.
Conception, construction et caractérisation de circuits génétiques dynamiques dans des bactéries: La conception et la construction de "parts" en biologie synthétique n'est pas triviale et nécessite de nombreuses conditions. Les "parts" utilisées dans des circuits génétiques devraient être modulaires, bien caractérisées avec un devenir précis et robustes aux changements de l'environnement. Elles devraient être résistantes aux interférences avec l'environnement et aux mutations. Aussi, elles devraient être proprement modélisées sur la base de paramètres dérivés d'expériences au niveau d'une seule cellule. Dans ma thèse, j'ai cherché en détails les conditions nécessaires à l'ingénierie de "parts" individuelles telles que promoteurs, sites de fixation de ribosomes, facteurs de transcription et quelques importants types de dispositifs. De plus, j'ai établi une plate-Forme pour la caractérisation de dispositifs génétiques au niveau d'une cellule unique. Tout le matériel et savoir-Faire nécessaires à l'ingénierie de dispositifs microfluidiques ont été acquis. Le procédé complet depuis la conception de dispositifs microfluidiques de leur fabrication à leur utilisation fonctionnelle pour des expériences microbiennes a été développée avec succès. Un outil d'analyse d'images acquises à partir d'expériences de microscopie parallélisé sur ordinateur a aussi été developpé. Les résultats expérimentaux ont prouvé que les dispositifs développés avaient un comportement conforme aux attentes théoriques. De plus, les protocoles expérimentaux, de fabrication et l'analyse automatique de données se sont avérés être adaptés et efficaces pour la caractérisation au niveau d'une cellule unique des bactéries développées.