Most enzyme reactions involve formation and cleavage of covalent bonds, while electrostatic effects, as well as dynamics of the active site and surrounding protein regions, may also be crucial. Accordingly, special computational methods are needed to provide an adequate description, which combine quantum mechanics for the reactive region with molecular mechanics and molecular dynamics describing the environment and dynamic effects, respectively. In this review we intend to give an overview to non-specialists on various enzyme models as well as established computational methods and describe applications to some specific cases. For the treatment of various enzyme mechanisms, special approaches are often needed to obtain results, which adequately refer to experimental data. As a result of the spectacular progress in the last two decades, most enzyme reactions can be quite precisely treated by various computational methods.
13 February 2007 in Theoretical Chemistry Accounts
Sohár Pál 1955-ben került a Budapesti Műszaki Egyetem Vegyészmérnöki Karára. Aktívan részt vett az egyetemi életben, az 1956-os forradalom alatt egyike volt annak a három hallgatónak, akik az egyetemi diákság közösen fogalmazott proklamációját sokszorosították, a lapokat szétosztották a felvonulók között. Szerencséjére ez nem jutott az egyetemi pártvezetés tudomására, bár gyanakodtak rá. Valószínűleg ezért talált munkát a diploma megszerzése után csak a Kelenföldi Tejipari Vállalatnál. Innen került Varsányi György ajánlására a Gyógyszerkutató Intézetbe, ahol a spektroszkópiai laboratórium vezetője lett. Holly Sándorral közösen megírta az infravörös, egyedüli szerző- ként pedig az NMR-spektroszkópia magyar nyelvű, azóta is használt kézikönyvét.