Guray Gurkan

Dr. Guray Gurkan


Research Focus & Metrics

Academic Career Length

8Years (2019-Present)

(Calculated once Scilit publication data is synced: current year − year of first publication + 1)

Representative Publications

View All Publications
6 May 2019 in IEEE Access
Verified
Journal Article
Open access
GGGuray Gurkan
Guray Gurkan
KGKoray Gurkan
Koray Gurkan
Microplate (i.e. microwell plate) is a flat plate that has a specific number of wells to be used as small test tubes in cell-culture studies. In most of the low-budget mammalian cell study laboratories, highly skilled laboratory personnel should determine microscopic changes in microplate well media by taking the microplate outside the incubator and by imaging each well medium under a microscope, with the risk of contamination and reliability degrading. An alternative solution is to use an in-incubator operated live-cell imaging device, which, however, cannot be afforded by low-cost laboratories. In this paper, we present the design, realization, and test stages of a microplate compatible inverted bright-field microscope system that can be used in incubators. The developed system enables real-time and long-term in-incubator imaging of any user-selectable microplate type. The device can capture bright-field microscopic images by using a low-cost CMOS image sensor, an inverted varifocal CCTV lens and an array of light emitting diodes. In addition, by developed two-axial movement stage and image augmenting algorithms, the whole area of a user selectable well (e.g. area of a 6.5 mm diameter well in a 96-well plate) can be automatically imaged without using any other third party software. The long-term performance of the system is tested in incubators with human embryonic kidney and breast cancer cell lines.

27 December 2020 in Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering
Verified
Journal Article
Closed access
GGGuray Gurkan
Guray Gurkan
This article presents the realization of a low-cost wearable sensor system and its Python-based software that can measure and record relative head-torso angle, especially in sagittal plane. The system is mainly developed to track head-torso angle during walk in a clinical study. The open-hardware part of the system is composed of a pair of triaxial digital accelerometers, a microprocessor, a Bluetooth module and a rechargeable battery unit. The reception of the transmitted acceleration data, visualization, interactive sensor alignment, angle estimation and data-logging are realized by the developed open-source graphical user interface. The system is tested on a tripod for verification and on a subject for practical demonstration. Developed system can be constructed and used for ambulatory monitoring and analysis of relative head-torso angle. Open-source user interface can be downloaded and developed for further (different) algorithms and device hardware.

31 December 2023 in Turkish Journal of Astronomy and Astrophysics
Verified
Journal Article
Closed access
MDMeryem Kübra Dağ
Meryem Kübra Dağ
TGTolga Güver
Tolga Güver
SÖSuat Özkorucuklu
Suat Özkorucuklu
GGGuray Gurkan
Guray Gurkan
ZGZahide Funda Bostanci Güver
Zahide Funda Bostanci Güver
CYCahit Yeşi̇lyaprak
Cahit Yeşi̇lyaprak
Kozmik ışınlar, oldukça geniş bir enerji aralığına sahip temel yüklü parçacıklardan ve çekirdeklerden oluşur. Bazıları Güneş’ten kaynaklanırken, diğerleri yıldızlararası uzayda süpernova patlamaları ve diğer çok yüksek enerjili olaylar sonucunda bize ulaşır. Bu parçacıklar Dünya’nın üst atmosferiyle etkileşime geçerek ikincil parçacıklara bozunurlar. Burada odaklandığımız ikincil parçacık olan Müon, ömrü 2,5 mikrosaniye kadar kısa olmasına rağmen ışık hızına yakın hızlarda hareket etmesi sebebiyle görelilik etkilerine maruz kalır ve yer tabanlı dedektörler tarafından kolaylıkla tespit edilebilirler. Müon akısındaki değişimlerde Güneş’in rolü son derece önemlidir. Kozmik ışın akısı ile güneş aktivitesi arasında bir ilişki olup olmadığına dair birçok çalışma bulunmaktadır. Bu çalışmalar zaman bağlamında ikiye ayrılabilir; Uzun vadeli değişiklikler olarak Güneş’in 11 yıllık aktivite döngüsü boyunca Kozmik Işın akısının takibi ve kısa vadeli (gün, saat bazında) Kozmik Işın akısının ani düşüşünü gözlemleyerek Güneş aktivitesi ile korelasyonunun takibi (Forbush Azalması) Müon akısının zamanla değişiminin takibi için bu çalışmada sunulan bir kozmik ışın dedektörü kurulup çalıştırılmıştır. Dedektör MIT üniversitesinden S.Axani ve arkadaşları tarafından kurulan CosmicWatch Taşınabilir Kozmik Müon Dedektörü esas alınarak kurulmuştur (Axani et al. 2018). Cosmic Watch dedektörü, Müon dedektasyonu alanına minyatürize edilmiş bir giriş niteliği taşımaktadır. Yapımının kolay ve anlaşılır olması, arka planındaki fiziğin anlaşılır olması esas alınması açısından önemli bir faktördür. Bu çalışmada kurduğumuz dedektörün temel düzeneği ve alınan ilk 41 saatlik veri paylaşılacaktır.