Diego A Zárate

Dr. Diego A Zárate


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29 October 2019 in Revista Facultad de Ingeniería
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HLHenry Lamos
Henry Lamos
DPDavid Esteban Puentes-Garzón
David Esteban Puentes-Garzón
DZDiego A Zárate
Diego A Zárate
The identification of influencing factors in crop yield (kg·ha-1) provides essential information for decision-making processes related to the prediction and improvement of productivity, which gives farmers the opportunity to increase their income. The current study investigates the application of multiple machine learning algorithms for cocoa yield prediction and influencing factors identification. The Support Vector Machines (SVM) and Ensemble Learning Models (Random Forests, Gradient Boosting) are compared with Least Absolute Shrinkage and Selection Operator (LASSO) regression models. The considered predictors were climate conditions, cocoa variety, fertilization level and sun exposition in an experimental crop located in Rionegro, Santander. Results showed that Gradient Boosting is the best prediction alternative with Coefficient of determination (R2) = 68%, Mean Absolute Error (MAE) = 13.32, and Root Mean Square Error (RMSE) = 20.41. The crop yield variability is explained mainly by the radiation one month before harvest, the accumulated rainfall on the harvest month, and the temperature one month before harvest. Likewise, the crop yields are evaluated based on the kind of sun exposure, and it was found that radiation one month before harvest is the most influential factor in shade-grown plants. On the other hand, rainfall and soil moisture are determining variables in sun-grown plants, which is associated with the water requirements. These results suggest a differentiated management for crops depending on the kind of sun exposure to avoid compromising productivity, since there is no significant difference in the yield of both agricultural managements.

1 February 2021 in Revista de Biologia Tropical
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EREdgar Javier Rincón-Barón
Edgar Javier Rincón-Barón
DZDiego A Zárate
Diego A Zárate
GCGenaro Andrés Agudelo Castañeda
Genaro Andrés Agudelo Castañeda
VCViviana Lucia Cuarán
Viviana Lucia Cuarán
LPLilian M. Passarelli
Lilian M. Passarelli
Introducción: a pesar de que T. cacao es una especie importante a nivel mundial por la producción de cacao, es poco lo que se conoce sobre la micromorfología y estructura de las anteras y los granos de polen. Objetivos: Describir y analizar la estructura y micromorfología de las anteras y los granos de polen de 10 genotipos élite de esta importante especie tropical. Métodos: Se tomaron más de 30 anteras de flores en antesis de los 10 genotipos élite de T. cacao del banco de germoplasma ex situ del Centro de Investigaciones Suiza-Agrosavia (Rionegro, Santander-Colombia). El material se procesó de acuerdo con los protocolos estándar para embeber y seccionar en parafina. Las secciones obtenidas (3 μm) se tiñeron con azul de Safranina-Alcian para discriminar estructuras con paredes primarias y secundarias y polifenoles totales. Además, se usó la técnica PAS-Amidoblack para diferenciar entre polisacáridos estructurales y de reserva, así como proteínas. Para la determinación de esporopolenina y polifenoles se usó la tinción azul de toluidina y finalmente para descripciones adicionales se aplicó la tinción azul alcián-PAS-hematoxilina. Las observaciones se realizaron mediante microscopio fotónico y microscopio de epifluorescencia. Para la observación con microscopía electrónica de barrido (MEB), las anteras con los granos de polen se fijaron y deshidrataron en 2.2 dimetoxipropano, luego se desecaron hasta un punto crítico y finalmente se recubrieron con oro. Resultados: las anteras son bitecas y están sostenidas por un largo filamento formado por un estrato epidérmico, tejido parenquimatoso y un haz vascular. La dehiscencia ocurre longitudinalmente a través del estomio. La pared de la antera madura está formada por una capa epidérmica monoestratificada, una capa de células endoteliales con engrosamientos fibrilares lignificados y se pueden apreciar restos celulares del tapete y abundantes orbículas recubriendo la cavidad de los microesporangios. Los tejidos epidérmicos y parenquimatosos de las anteras almacenan polifenoles. Las orbículas son generalmente esféricas, psiladas y exhiben las mismas reacciones de tinción y fluorescencia que la exina de los granos de polen. Los granos de polen son mónades, isopolares, pequeños (16-19 µm) con amb circular, esferoidales, tricolpados con colpos medianos o cortos (5-10 µm) con membrana ornamentada, semitectatos, reticulados, heterobrochados, las paredes del retículo ornamentadas o no, con microgránulos de diferente tamaño o escabrados. Los análisis estadísticos mostraron que existen diferencias significativas en el tamaño de los granos de polen (P ˂ 0.05). Se observa que los granos de polen más pequeños son los del genotipo TCS 19 (16.890 µm) y se diferencian del resto de genotipos, y entre estos no se observan diferencias significativas. Solo dos genotipos (SCC 19 y SCA 6) presentaron polenkit y solo uno tiene paredes perforadas (SCA 6). Conclusiones: la estructura y micromorfología de las anteras de T. cacao son similares a las descritas para otras Malvaceae. Así mismo, los granos de polen mostraron variaciones de tamaño, ornamentación de las paredes y del lumen del retículo y presencia de polenkit. Sin embargo, no se observó relación entre las variaciones de los caracteres micromorfológicos analizados en los granos de polen y los modelos de compatibilidad polínica reportados para estos genotipos.

1 January 2015
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PSPablo R. Stevenson
Pablo R. Stevenson
DZDiego A Zárate
Diego A Zárate
MRMónica A. Ramírez
Mónica A. Ramírez
FHFrancisco Henao-Díaz
Francisco Henao-Díaz

1 June 2019 in CERNE
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ASAndrés Iván Prato Sarmiento
Andrés Iván Prato Sarmiento
DZDiego A Zárate
Diego A Zárate
JPJhon Jairo Zuluaga Peláez
Jhon Jairo Zuluaga Peláez
SGSandra Liliana Castañeda Garzón
Sandra Liliana Castañeda Garzón
Aiming at contributing to the knowledge of the biology and propagation of Cariniana pyriformis Miers, a native species with high timber and ecological attributes, ripe fruits were harvested. Initially, in 400 seeds and 320 fruits, the size, fresh mass, seed water content, number of seeds per fruit, number of seeds per kilogram and fruit color were assessed. Then, a homogenous seed sample was immersed for 24 hours in five doses (0, 250, 500, 750 and 1000 mg.L-1) of gibberellins (GA3) and cultivated in a greenhouse. For this, a completely randomized design was adopted with six replications of 25 seeds each. Fruits and seeds showed values, on average ± standard deviation, of 76.1 ± 11 mm and 48.1 ± 8.2 mm in length, and 49.6 ± 5 mm and 7.2 ± 0.7 mm of width, respectively, with 62.3 ± 22.3 g of fresh mass per fruit and 13 ± 3.1 seeds per fruit. One kilogram corresponded on average to 6715 seeds with 11% water content. In the greenhouse, emergence speed index and emergency percentage of seedlings increased as the GA3 dose increased, allowing a more concentrated emergency process in a shorter period. Highest variation was found for fresh mass per fruit (CV= 35%) and number of seeds per fruit (CV= 24%). Immersion in 1000 mg.L-1 in GA3 for 24 hours triggers seedling emergency in C. pyriformis (approx. 71%), and then it is recommended for plant propagation, since the treatment accelerated and synchronized seedling emergency.

1 January 2020 in Respuestas
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CPCristian Palencia-Blanco
Cristian Palencia-Blanco
AGAlejandra Gualdrón-Zambrano
Alejandra Gualdrón-Zambrano
IHIsabel Guarín - Henao
Isabel Guarín - Henao
YOYuly Ojeda-Galeano
Yuly Ojeda-Galeano
AVArley Villamizar-Jaimes
Arley Villamizar-Jaimes
LLLuis Javier López-Giraldo
Luis Javier López-Giraldo
Seventy-four volatile compounds were identified and quantified from cocoa liquors of the ICS 95 and TCS 01 varieties produced in the department of Santander, Colombia. The compounds were extracted using the solid phase microextraction with head space (SPME-HS) technique, and identified by gas chromatography coupled to mass spectrometer (GC-MS) by comparing the mass spectra of each compound in the Wiley 275L library of mass spectra and the Kovats retention index (IK) ratio. A semi-quantitative method was proposed that included toluene as an internal standard to normalize the degree of recovery between samples and a response factor for each family, calculated using a compound characteristic of that functional group. The results associated with response factors for each family or group of compounds such as alcohols, acids, aldehydes, ketones, esters and pyrazines (2.19, 1.02, 2.84, 0.38, 6.38, 0.88 respectively) were different between families, however, there was no difference between compounds within the same family. The implemented method obtained a DOD and DML of 0.024 µg/kg and 0.037 µg/kg respectively and an accuracy expressed as percentage recovery (of characteristic compounds per family) of 96% on average. According to the precision of the method, the results show that the concentrations have an average coefficient of variation (%CV) of 7.38% assuring repeatability and good precision. Finally, for the analyzed and quantified samples, it was found that the compounds with higher concentration were acetic acid (42.633 mg/kg), 2-phenylethyl acetate (29.44 mg/kg), 2.3-butanediol (345.39 mg/kg), 2-phenylethanol (12.595mg/kg) and 2.3.5.6-tetramethylpyrazine (8.601 mg/kg).

3 August 2021 in Revista de Biologia Tropical
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EREdgar Javier Rincón-Barón
Edgar Javier Rincón-Barón
GTGerardo Andrés Torres-Rodríguez
Gerardo Andrés Torres-Rodríguez
LPLilian M. Passarelli
Lilian M. Passarelli
DZDiego A Zárate
Diego A Zárate
VCViviana Lucia Cuarán
Viviana Lucia Cuarán
SPSayonara Plata-Arboleda
Sayonara Plata-Arboleda
Introducción: Los estudios sobre microsporogénesis, micromorfología y estructura de los granos de polen en Malvaceae son escasos. Objetivos: Describir el proceso de microsporogénesis y aspectos micromorfológicos de los granos de polen en A. rosea. Métodos: Se procesaron más de 30 andróforos de acuerdo con los protocolos estándar para incrustar y seccionar en parafina. Las secciones obtenidas se tiñeron con azul de Safranina-Alcian, las anteras inmaduras y no fijadas se tiñeron con azul de anilina. Se procesaron secciones de resina adicionales de los andróforos y se tiñeron con azul de toluidina. Se observaron secciones ultrafinas con microscopía electrónica de transmisión (TEM). Para la observación con microscopía electrónica de barrido (SEM), el material se fijó y deshidrató en 2,2 dimetoxipropano, luego se secó hasta un punto crítico y se recubrieron con oro. Resultados: las anteras se diferencian de una masa celular en los extremos distales de los filamentos del estambre. La pared de la antera madura presenta una capa externa de células epidérmicas y una capa interna, el endotecio. Las células madre de microesporas se dividen por mitosis y luego experimentan meiosis para formar tétradas. El tapete es inicialmente celular y forma una sola capa de células y luego pierde integridad celular al invadir el lóculo de microsporangio, formando un periplasmodio. Durante la formación de la esporodermis, primero se deposita la exina y luego la intina. Para el momento de la liberación de los granos de polen, el tapete se ha degenerado por completo. Los granos de polen son pantoporados, apolares, con simetría radial, esferoidales, con espinas, bacula, gránulos y microgránulos. El tectum está perforado con foveolea dispuesta homogéneamente en toda la superficie y con polenkit. La exina es ancha (5-6 µm) y consta de una endexina gruesa de 3.5 a 4 µm y una ektexina fina (0.6-0.7 µm). La ultraestructura muestra columelas claramente definidas formando el infratectum. Se aprecian tricomas nectaríferos unicelulares glandulares capitados (TG) cubriendo toda la superficie de los filamentos de los estambres. Conclusiones: La estructura y desarrollo de las anteras sigue los patrones conocidos de las angiospermas. La microsporogénesis simultánea y el depósito centrípeto de la esporodermis se han descrito previamente para Malvaceae.