The stalk, ear and root rot (SERR) of maize caused by Fusarium verticillioides (Fv) severely impacts crop production in tropical and subtropical regions. The aim of the present work was to screen bacterial isolates in order to find novel native biocontrol agents against Fv. A culturable bacterial collection consisting of 11,520 isolates enriched in Firmicutes and Proteobacteria was created from rhizosphere samples taken from SERR symptomatic or asymptomatic maize plants. The complete collection was screened for potential activity against Fv using a liquid antagonism assay followed by dual cultures in solid medium, selecting for 42 bacteria (Bacillus, Pseudomonas and Paenibacillus) that inhibit Fv growth (>45 %). In planta assays demonstrated that three Bacillus isolates: B. megaterium (B5), B. cereus sensu lato (B25) and Bacillus sp. (B35) displayed the highest antagonistic activity against Fv. Pot experiments performed in a greenhouse with Bacillus cereus sensu lato B25 confirmed these findings and showed a reduction of Fv disease severity and incidence on plants. Antagonistic activity analysis revealed that these strains produce glucanases, proteases or chitinases, as well as siderophores and auxins and suggests these as possible control mechanisms against Fv.

La diversidad de los microorganismos asociados a la rizosfera de diferentes especies vegetales en los suelos en México ha sido poco estudiada y ha sido abordada convencionalmente con técnicas microbiológicas las cuales son limitadas debido a que existe un porcentaje elevado de microorganismos no-cultivables (95-99%). El presente trabajo usa la secuenciación del ADN ribosomal (ADNr) para evitar esta limitante y explorar mejor la diversidad de los microorganismos cultivables y no-cultivables asociados a tomate (Solanum lycopersicum, L.) en un agroecosistema en Sinaloa. Se empleó ADN genómico extraído de la suelo rizosferico para amplificar una región hipervariable en el ADNr empleando oligonucleótidos universales para ADNr procariota y eucariota. El análisis de de 476 y 441 secuencias de ADNr de origen procariótico y eucariótico respectivamente, mostró que los phyla eucariotes más abundantes fueron: Ascomycota (62.1%), Chlorophyta (17.6%) y Basidiomycota (11.4%); y los de origen procariote más abundantes fueron Firmicutes (43%), Acidobacteria (17.2%) y Proteobacteria (11.6%). El presente trabajo representa, hasta donde tenemos información, la caracterización más completa de la diversidad de microorganismos de la rizosfera asociados a tomate a la fecha. Se discute el papel que especies pertenecientes a géneros procariotas (Bacillus y Paenibacillus) y eucariotas (Alternaria) pudieran jugar en el control biológico de fitopatogénos en la rizosfera.