En el presente estudio se analizó la concentración de 16 hidrocarburos aromáticos policíclicos (HAPs) en agua superficial y subterránea en la subregión de La Mojana Sucreña, en el periodo 2022-2023. Algunos índices moleculares se emplearon para estimar el origen de la contaminación y el transporte de los HAPs. Las concentraciones de los 16 HAPs fueron más bajas en el agua superficial (promedio de 133 ng/L) que para el agua subterránea (promedio de 234,3 ng/L); para cada tipo de agua se observaron variaciones dependiendo de la época de muestreo, la media general de la sumatoria de HAPs fue 209 ±27 ng/L. El agua del Arroyo Canoas presentó la concentración más elevada (promedio de 335,77 ±305,68 ng/L), seguido de la ciénaga La Chana (promedio de 294,93 ±257,7 ng/L) y de la ciénaga Galindo (promedio de 223,2 ng/L); por su parte, para el agua subterránea, el pozo de comunidad de El Pando mostró los niveles más elevados de Sumatoria de HAPs (promedio de 932,5 ±755,2 ng/L), seguido del pozo de la comunidad de Gavaldá (promedio de 529,3 ±317,4 ng/L) y del pozo de la comunidad de La Concordia (promedio de 370,4 ± 201,9ng/L). Se encontró un predominio considerable de HAPs de bajo peso molecular, donde el naftaleno y fenantreno fueron los compuestos dominantes. En cuanto a la época de muestreo, se encontró que puede afectar significativamente el perfil de los HAPs en el agua superficial y subterránea, modificando las posibles fuentes y el predominio de uno o varios de compuestos; se observó que, para la época de lluvia, existe mayor frecuencia de HAPs de alto peso molecular en el agua superficial. En cuanto a la posible fuente de los HAPs en el agua de la región de La Mojana, la relación HAPs ligeros/HAPs pesados < 1 para 25 pozos sugirió, como una posible fuente común, la combustión, lo que es confirmado con los valores entre 0,4 y 0,.6 para los índices de fluoranteno/fluoranteno + pireno y benzo[a]antraceno/ benzo[a]antraceno + criseno estimados en la mayoría de los sitios de monitoreo. La región de La Mojana se caracteriza por su economía basada en la agricultura, la ganadería y la pesca, sin el desarrollo de industrias ni de actividades de explotación de hidrocarburos; sin embargo, sobre todo para el agua subterránea, las concentraciones de HAPs son más altas que las del agua subterránea de otras regiones donde no existen actividades asociadas al uso de hidrocarburos ni grandes industrias.