Cupuaçu (Theobroma grandiflorum) from the Malvaceae family, has seeds rich in flavonoids. The biological activities of seeds are diverse, however, there are scarce data on these metabolites. The study aimed to evaluate, through in silico methods, the biological, toxicological, and pharmacokinetic potential of metabolites present in the cupuaçu seed. The metabolites hypolaetina 3'-methylether 8-O-β-D glucuronide, theograndin II, hypolaetina 3'-methylether 8-O-β-D 3”-sulfated glucuronide, isoscutellarein 8-0-β-D glucuronide and theograndin I were analysed through Pubchem to search for structures, and PreADMET (pharmacokinetics and toxicity) and PASS online for biological activities (PA >98%). The results demonstrated low human intestinal absorption, in addition to weak to moderate distribution across the blood-brain barrier. All phenolic compounds showed weak to moderate binding to plasma proteins and low permeability in CaCo2 cells, except for isoscutelarein 8-0-β-D glucuronide and hypolaetina 3'-methylether 8-O-β-D glucuronide with moderate permeability, being non-mutagenic. Furthermore, they had the potential to inhibit CYPs, such as CYP-2C9 and CYP-3A4. Also, the structures showed toxicity in Medaka fish, but they did not present toxicity in algae and Daphnia sp. Finally, the molecules presented the following main properties: hemostatic, cardioprotective, and antioxidant action, among others. The compounds presented varied biological activity profiles, but their pharmacokinetic and toxicity were not promising, limiting the potential for developing new drugs. The use of technologies is suggested to transform them into prodrugs, carriers, and the use of molecular modeling. El cupuaçu (Theobroma grandiflorum) de la familia Malvaceae, tiene semillas ricas en flavonoides. Las actividades biológicas de las semillas son diversas, aunque hay escasez de estudios sobre estos metabolitos. El objetivo del estudio fue evaluar, mediante métodos in silico, el potencial biológico, toxicológico y farmacocinético de los metabolitos presentes en las semillas de cupuaçu. Se analizaron los metabolitos: hipolaetina 3'-metiléter 8-O-β-D glucurónido, theograndina II, hipolaetina 3'-metiléter 8-O-β-D glucurónido 3”-sulfatado, isoscutelareína 8-0-β-D glucurónido y theograndina I, utilizando PubChem para buscar las estructuras, PreADMET (farmacocinética y toxicidad) y PASS online para actividades biológicas (PA > 98%). Los resultados de las moléculas mostraron baja absorción intestinal humana, así como distribución débil a moderada en la barrera hematoencefálica. Todos los compuestos fenólicos presentaron una unión débil a moderada a proteínas plasmáticas y baja permeabilidad en células CaCo2, excepto isoscutelareína 8-0-β-D glucurónido y hipolaetina 3'-metiléter 8-O-β-D glucurónido, que presentaron permeabilidad moderada y no fueron mutagénicos. Además, mostraron potencial para la inhibición de CYPs, como CYP-2C9 y CYP-3A4. Las estructuras también presentaron toxicidad en peces Medaka, sin embargo, no mostraron toxicidad en algas y Daphnia sp. En cuanto a las actividades biológicas, las moléculas presentaron propiedades principales como acción hemostática, cardioprotectora, antioxidante, entre otras. Aunque los compuestos mostraron diversos perfiles de actividades biológicas, sus perfiles farmacocinéticos y de toxicidad no fueron prometedores, lo que limita el potencial para el desarrollo de nuevos fármacos. Se sugiere explorar tecnologías como la transformación en profármacos, transportadores y el uso de modelado molecular. O cupuaçu (Theobroma grandiflorum) da família Malvaceae, possui sementes ricas em flavonoides. As atividades biológicas das sementes são diversas, entretanto, há escassez de estudos desses metabólitos. O objetivo do estudo foi avaliar, por métodos in silico, o potencial biológico, toxicológico e farmacocinética de metabólitos presentes na semente do cupuaçu. A análise ocorreu nos metabólitos: hipolaetina 3’-metiléter 8-O-β-D glicuronídeo, theograndina II, hipolaetina 3’-metiléter 8-O-β-D glicuronídeo 3”-sulfatado, isoscutelareína 8-0-β-D glicuronídeo e theograndina I, através do Pubchem para busca das estruturas, PreADMET (farmacocinética e toxicidade) e o PASS online para atividades biológicas (PA >98%). Os resultados das moléculas demonstraram baixa absorção intestinal humana, além de fraca a moderada distribuição na barreira hematoencefálica. Todos os compostos fenólicos apresentaram fraca a moderada ligação a proteína plasmática e baixa permeabilidade em células CaCo2, com exceção da isoscutelareína 8-0-β-D glicuronídeo e da hipolaetina 3’-metiléter 8-O-β-D glicuronídeo com moderada permeabilidade, sendo não mutagênica. Ademais, apresentaram potencial para inibição de CYPs, como a CYP-2C9 e a CYP-3A4. Também, as estruturas apresentaram toxicidade em peixes Medaka, no entanto, não apresentaram toxicidade em algas e Daphnia sp. Enfim, em relação às atividades biológicas, as moléculas apresentaram como principais propriedades: ação hemostática, cardioprotetora, antioxidante, entre outras. Os compostos apresentaram variados perfis de atividades biológicas, mas seus perfis farmacocinéticos e de toxicidade não foram promissores, limitando o potencial para desenvolvimento de novos fármacos, sugere-se a utilização de tecnologias, como...