Durante mucho tiempo, la medicina estudió al ser humano como un organismo individual, compuesto por células, tejidos, órganos y sistemas. Desde esta perspectiva, los microorganismos fueron considerados principalmente agentes causantes de enfermedades que debían ser identificados, controlados o eliminados. Este enfoque permitió avances decisivos en el desarrollo de vacunas, antibióticos y medidas de salud pública; sin embargo, los conocimientos recientes han demostrado que esta visión es necesaria, pero incompleta. El cuerpo humano alberga comunidades microbianas complejas y dinámicas. Bacterias, arqueas, hongos, virus y otros microorganismos habitan distintos espacios del organismo y participan en procesos relacionados con la nutrición, el metabolismo, la inmunidad, la protección frente a patógenos y la comunicación entre órganos. Por ello, el ser humano no puede comprenderse completamente como un organismo aislado, sino como un sistema biológico que mantiene una relación permanente con sus comunidades microbianas. En este contexto, el estudio del microbioma representa uno de los cambios conceptuales más importantes de la medicina contemporánea. Mientras la microbiota se refiere a los microorganismos presentes en un ambiente determinado, el microbioma comprende también sus genes, metabolitos, funciones e interacciones. Esta diferencia permite superar una visión limitada basada únicamente en identificar especies y conduce a una comprensión más amplia de las funciones que desempeñan dentro del organismo. El presente libro ofrece un recorrido por esta nueva dimensión de la biología humana. Sus capítulos abordan los fundamentos del microbioma, la relación entre el huésped y los microorganismos, su participación en el metabolismo y la inmunidad, así como su vínculo con diversas enfermedades. También se revisan sus principales aplicaciones médicas, entre ellas los probióticos, prebióticos, el trasplante de microbiota fecal, la secuenciación, la culturomía, la farmacomicrobiómica y el desarrollo de nuevas estrategias terapéuticas. La obra también examina el futuro de la medicina basada en el microbioma. Herramientas como la inteligencia artificial, la bioinformática, la metabolómica, los organoides y la biología sintética están ampliando las posibilidades de investigación. No obstante, estos avances deben interpretarse con prudencia, pues una asociación no siempre demuestra causalidad y un resultado experimental no garantiza por sí solo un beneficio clínico. La investigación deberá avanzar acompañada de validación, seguridad, regulación y responsabilidad ética. Comprender el microbioma implica reconocer que la salud surge de la interacción entre el organismo humano, sus microorganismos, la alimentación, el ambiente, los medicamentos, la genética y el tiempo. La medicina del siglo XXI tendrá que integrar los conocimientos de la microbiología clásica con las herramientas de la biología molecular, la ciencia de datos y la práctica clínica. Este libro está dirigido a estudiantes, docentes, profesionales de la salud, investigadores y lectores interesados en comprender una de las áreas más dinámicas de la biomedicina actual. Su propósito no es ofrecer respuestas definitivas, sino aportar fundamentos para interpretar críticamente los avances y desafíos de la medicina basada en el microbioma. En última instancia, estudiar estas comunidades microscópicas también significa ampliar nuestra comprensión de lo que somos.