Glaesserella parasuis is an important bacterial pathogen and the etiological agent of Glässer’s disease, which causes substantial economic losses on swine farms worldwide. Although large scale genome studies have been carried out in the North hemisphere, few genomes from South America are available limiting our knowledge of the full genetic diversity of this bacteria. In this study, seventeen clinical G. parasuis isolates from diseased swine in Peru where whole genome sequenced and compared with publicly available genomes. We identified seven distinct sequence types and five serotypes being more prevalent: the emergent ST454 and novel ST726 and serotypes 7 and 12. Although most isolates did not carried any antimicrobial resistance gene (ARG) we identified a large cassette of ∼50 kb carrying nine different ARGs (aac(3)-IV, aph(3′)-Ia, aph(3′)-Ib, sul2, bla_ROB–1tetB, lnuH, estT and floR) including six tandem repeats of estT and floR genes. We also identified two coexisting small plasmids harboring tetH, estT and bla_ROB–1 in two isolates. Most of the isolates (88.2%, 15/17) harbored at least one group 1 vtaA virulence gene. The G. parasuis diversity was segregated in two clades (C1 and C2) by phylogenetic and gene content analysis. We identified several genes overrepresented in both clades, however three metabolic operons (glnHMPQ, hisGDCBHAFI, thiDEM) were almost exclusive of C2 strains suggesting that C1 strains are auxotrophs for histidine and thiamine important nutrient for bacterial survival which may impact in the adaptation of these strains to the host niche. Our results suggest a high diversity of G. parasuis strains circulating in Peru, the presence of mobile elements carrying multiple ARGs underscores the need for continuous surveillance of this pathogen within the Peruvian swine industry to identify potential vaccine candidates and formulate better control programs.

El objetivo del presente estudio fue identificar molecular y serológicamente Salmonella spp presentes en aislados de huevos, canales y vísceras aviares. Se evaluaron 46 aislados de origen aviar identificados como Salmonella spp mediante cultivos y pruebas bioquímicas en el periodo 2012-2017, procedentes de varios distritos de la ciudad de Lima. Estos aislados son conservados en el cepario de Laboratorio de Bacteriología de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Se reactivaron las cepas, y se reconfirmaron las colonias sospechosas a Salmonella spp mediante el cultivo en medios selectivos. Posteriormente se realizó el PCR a las muestras sospechosas como método de diagnóstico genético de Salmonella. Se detectó el gen de invasividad invA, gen involucrado con la virulencia de Salmonella. Se realizó la serotipificación con antisueros polivalentes y monovalentes para serogrupo y serovar en el Laboratorio de Enteropatógenos del Instituto Nacional de Salud (INS), y finalmente se determinaron las serovariedades de acuerdo con el esquema propuesto por Kauffmann-White. Las 46 cepas evidenciaron bandas de peso molecular correspondientes al gen invA (244 pb). Todas las cepas fueron identificadas mediante serotipificación, obteniendo: S. Infantis (34.8%), S. Pullorum (34.8%), S. Gallinarum (15.2%), S. Enteritidis (8.7%) y S. Typhimurium (6.5%). Los resultados revelan la predominancia de los serovares circulantes en muestras aviares, así como su implicancia en la salud pública.

En el Perú se vienen reportando serovares de Salmonella no tifoidea (SNT) en casos humanos que estarían relacionados a los hallados en huevos comerciales, carcasas de broilers y subproductos. El presente estudio tuvo como objetivo determinar mediante el porcentaje de similaridad de los perfiles genéticos de los serovares de SNT aislados de humanos y productos aviares mediante la Electroforesis en Gel de Campo Pulsado (PFGE). Se obtuvieron 49 aislados bacterianos de serovares de SNT de casos clínicos humanos y productos aviares (huevos, carcasa de broilers, vísceras, cama de ave), que se analizaron mediante PFGE. Con el programa bioinformático Bionumerics v. 7.0 se generó un dendrograma que muestra la relación XbaI – perfiles PFGE. El análisis de las bandas generadas se realizó mediante el uso del Método de grupo de pares no ponderados con media aritmética (UPGM) para evaluar la diversidad genética de los aislados. Se estableció como valor de corte 90% de similaridad entre los pulsotipos para establecer posibles relaciones. Se encontró que algunos aislados de origen humano y aviar de Salmonella Typhimurium, Kentucky e Infantis poseen pulsotipos idénticos lo que indica que los aislados corresponden a un mismo clon circulando entre humanos y productos aviares.