Desenho do estudo: Estudo retrospectivo de casos-controle. Objetivo: Identificar fatores de risco entre as características sociodemográficas, nutricionais e de saúde associados à anemia por deficiência de ferro em crianças menores de cinco anos de idade, atendendo à clínica de crescimento e desenvolvimento do Centro de Saúde Nueve de Enero de Chachapoyas durante 2019. Método: Foram formados dois grupos, cada um formado por 50 crianças. O grupo 1 (G1, casos) eram crianças diagnosticadas com anemia por deficiência de ferro e um grupo controle (GC) de crianças saudáveis, com idade compatível, residentes na mesma jurisdição. Os dados foram coletados dos registros médicos do centro de saúde, em uma ficha de registro estruturada com base nas variáveis do estudo: idade, peso ao nascer, doenças parasitárias ou sintomas associados, como diarréia, freqüência e tipo de alimentação antes e depois dos seis meses de idade. Os dados foram agrupados em tabelas de contingência para o cálculo do Odds Ratio (OR), e a significância estatística foi estimada pela análise de variância (ANOVA) com 95% de confiança. Resultados: Todos os fatores considerados apresentaram associação significativa p<0,05, com exceção do sexo, no que diz respeito à presença de anemia em crianças. Com valores OR de: menos de 32 meses de idade (OR=2,26, 95% CI 0,59-2,79), menos de 2900 g de peso ao nascer (OR=2,98, 95% CI 0,43-2,99), amamentação exclusiva prolongada (OR=3,14, 95% CI 1. 55-3. 88), ablactação precoce (OR=4,96, 95% CI 1,27-5,07), baixo consumo de alimentos de origem animal (3,5, 95% CI 1,18-3,61), baixo consumo de frutas e vegetais (2,33, 95% CI 0,86-2,63), entre outros. Conclusão: Na população de Chachapoyas, os fatores considerados no estudo aumentam em mais de 93% o risco de desenvolver anemia em crianças com menos de cinco anos de idade. Sua probabilidade de ocorrência justifica uma reavaliação das estratégias aplicadas nos diferentes programas ou intervenções realizadas na área para o controle e prevenção da anemia.