The negative ecological impact of industrialization, which involves the use of petroleum products and dyes in the environment, has prompted research into effective, sustainable, and economically beneficial green technologies. For green remediation primarily based on active microbial metabolites, these microbes are typically from relevant sources. Active microbial metabolite production and genetic systems involved in xenobiotic degradation provide these microbes with the advantage of survival and proliferation in polluted ecological niches. In this study, we evaluated the ability of wheat root-associated L. fusiformis MGMM7 to degrade xenobiotic contaminants such as crude oil, phenol, and azo dyes. We sequenced the whole genome of MGMM7 and provided insights into the genomic structure of related strains isolated from contaminated sources. The results revealed that influenced by its isolation source, L. fusiformis MGMM7 demonstrated remediation and plant growth-promoting abilities in soil polluted with crude oil. Lysinibacillus fusiformis MGMM7 degraded up to 44.55 ± 5.47% crude oil and reduced its toxicity in contaminated soil experiments with garden cress (Lepidium sativum L.). Additionally, L. fusiformis MGMM7 demonstrated a significant ability to degrade Congo Red azo dye (200 mg/L), reducing its concentration by over 60% under both static and shaking cultivation conditions. However, the highest degradation efficiency was observed under shaking conditions. Genomic comparison among L. fusiformis strains revealed almost identical genomic profiles associated with xenobiotic assimilation. Genomic relatedness using Average Nucleotide Identity (ANI) and digital DNA–DNA hybridization (DDH) revealed that MGMM7 is distantly related to TZA38, Cu-15, and HJ.T1. Furthermore, subsystem distribution and pangenome analysis emphasized the distinctive features of MGMM7, including functional genes in its chromosome and plasmid, as well as the presence of unique genes involved in PAH assimilation, such as phnC/T/E, which is involved in phosphonate biodegradation, and nemA, which is involved in benzoate degradation and reductive degradation of N-ethylmaleimide. These findings highlight the potential properties of petroleum-degrading microorganisms isolated from non-contaminated rhizospheres and offer genomic insights into their functional diversity for xenobiotic remediation.

Журнал "Informatics. Economics. Management - Информатика. Экономика. Управление" (сетевое издание) издаётся редакцией ООО "Сибирский научный центр ДНИТ" с 2022 года. Цель журнала заключается как в вовлечении российских исследователей в международное научное пространство, что обеспечивается внедрением современных международных издательских практик, так и в содействии научной коллаборации российских и зарубежных авторов за счет знакомства иностранных исследователей с оригинальными исследованиями российских ученых по актуальным вопросам развития информатики, экономики и управления, не имеющим аналогов за рубежом. К публикации принимаются научные статьи проблемного и научно-практического характера, описывающие результаты исследований в области применения современных информационных технологий, математического моделирования, статистики, системного анализа и управления, экономики и финансов, проблем организации и экономики агропромышленного комплекса, передовых образовательных технологий, а также обзоры, содержащие сравнительный анализ применения современных методов и подходов в области информатики, экономики и управления. Редакция размещает научные статьи в открытых репозиториях с целью повышения доступности научных публикаций. Сразу после размещения на сайте статья считается опубликованной по принципу Online First. Каждая статья доступна как отдельный, самостоятельный документ в сети Интернет и имеет свой, уникальный URL. Каждой статье присваивается уникальный индекс DOI и EDN. Сетевой формат журнала и принцип открытого доступа позволяет обеспечить самый широкий охват читательской и авторской аудитории, что способствует высокому уровню цитируемости опубликованных статей. При использовании материалов ссылка на журнал и авторов статей обязательна. Главный редактор журнала - Игорь Владимирович Ковалев, доктор технических наук, профессор. СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций, регистрационный номер ЭЛ № ФС 77 - 83415 от 07.06.2022 (электронная версия). eISSN: 2782-5280 (онлайн)

Bacterial soft rot of potato is predominantly associated with members of the genera Pectobacterium and Dickeya, whereas the contribution of other bacterial taxa to the etiology of the disease remains insufficiently characterized. This study aimed to characterize a bacterial isolate recovered from potato tubers exhibiting naturally occurring soft rot symptoms in Kazakhstan and to evaluate its pathogenic potential. Twelve bacterial isolates were obtained from symptomatic tissue, of which only isolate ZA4 reproducibly caused pronounced tissue softening and maceration following wound inoculation of healthy tubers, whereas disease development remained minimal in the negative control. Reproduction of characteristic symptoms and subsequent reisolation of the bacterium from experimentally affected tissue fulfilled the principal criteria of Koch’s postulates. Multilocus phylogenetic analysis based on 16S rRNA, gyrB, rpoB, and pyrE sequences assigned isolate ZA4 to Bacillus altitudinis. When tested across five potato cultivars and one commercial sample of unknown cultivar identity, the proportion of macerated tissue ranged from approximately 60–85% at 24 h and varied among the tested materials, increasing to 95–98% at 48 h, indicating rapid progression of tissue maceration under the bioassay conditions. ZA4 also exhibited pectinolytic, cellulolytic, proteolytic, and amylolytic activities. These findings demonstrate that B. altitudinis ZA4 is capable of inducing pronounced tissue maceration and soft-rot symptoms in wounded potato tubers under artificial wound inoculation conditions. However, broader studies encompassing a larger number of samples and a wider geographic area are required to determine the occurrence and epidemiological significance of B. altitudinis in association with potato soft rot in Kazakhstan.

Phytophthora infestans is the causative agent of late blight and one of the most economically significant diseases of Solanaceous crops. Detached leaf assays are useful tools to efficiently assess how differing environmental conditions and management controls may affect the infection process and overall disease severity. However, these protocols need refinement to more fully reflect natural infection processes in the field. In a detached leaf assay experiment to study the infection rate and the development of late blight as affected by initial sporangia concentration, greenhouse-grown tomato (Solanum lycopersicum), potato (Solanum tuberosum), and eggplant (Solanum melongena) were used. The study showed a clear dose-dependent response: high concentrations of sporangia (50,000/ml and 10,000/ml) caused rapid and extensive spot formation, while at low concentrations (2,000/ml), symptoms were mild and control leaves remained healthy. The spread of the spots and the percentage of the affected area were assessed using the ImageJ program for 7 days. The results confirm the effectiveness of the detached leaf method for quantifying pathogen aggressiveness and provide insight into the early stages of host-pathogen interaction.

Рис является одной из стратегических культур в Казахстане. Для получения высоких и стабильных урожаев риса необходимо обеспечить хозяйства высококачественным семенным материалом, обладающим хорошими посевными качествами. Практика показывает, что в последнее время снижается качество высеваемых семян сельскохозяйственных культур, увеличивается инфицирование их комплексом патогенной и сапрофитной микрофлорой. Инфекционная нагрузка в семенах, каждый год вызывает большие потери урожая, при этом некоторые возбудители заболеваний выступают в качестве основного источника инфекции. Обработка семян один из приемов защиты на ранних этапах развития растений, не только от семенной и почвенной инфекции, но и против вредителей. Используя современные препараты для предпосевной обработки, можно получить здоровые всходы и предотвратить развитие многих инфекционных заболеваний. При этом особое внимание следует уделить фитоэкспертизе семян для установления патогенного комплекса семенной инфекции и их посевных качеств. Это позволит правильно подобрать протравитель и повысить эффективность предпосевной обработки, предотвратит плесневение семян, поражение корневыми гнилями и другими заболеваниями, передаваемыми через семена. Проведена фитоэкспертиза четырех сортов риса Маржан, Лидер, Айкерім и Янтарь во влажной камере и питательных средах – картофельно-глюкозный агар (КГА) и синтетическая среда Чапека (ЧА). При этом устанавливались посевные качества и патогенный комплекс семенной инфекции по общепринятым в фитопатологии методам. Установлено, что посевные качества семян четырех сортов соответствуют ГОСТу12038-84, существенной разницы по посевным качествам не выявлено. Однако 50% семян были покрыты плесенью. Выявлена доминирующая микрофлора. При этом на всех образцах семян риса доминировали грибы родов Alternaria, Fusarium и сапрофитные грибы родов Mucor, Penicillium, Aspergillus, а на сорте Лидер грибы - Pyricularia oryzae, возбудитель пирикуляриоза и Ascochyta oryzae, возбудитель аскохитоза. Наряду с грибной, доминировала и бактериальная микрофлора. Проведенная фитоэкспертиза позволит правильно подобрать эффективные протравители и стимуляторы для оздоровления семян и существенно улучшить их посевные качества и продуктивность растений, а также фитосанитарное состояние на плантациях риса