The study of the Continental Intercalaire aquifer system of southern Tunisia, based on the interpretation of geochemical (major elements) and isotopic (18O, 2H, 13C and 14C) data, has aided the understanding of the hydrodynamics of this multi-layer aquifer system, which is greatly influenced by tectonics. The determination of the origin of groundwater salinization and the understanding of the hydrogeological and geochemical behaviour of this aquifer were achieved by studying the correlation between the major elements and total mineralization (TDS). By using isotopic tools, it was shown that the water of this aquifer has been recharged under cooler, palaeoclimatic conditions. The technique also made it possible to better understand the hydrodynamic functioning of the aquifer system: it showed that the relatively recent recharge of the aquifer has been by direct infiltration from carbonate and sandy outcrops of the Cretaceous and Miocene, respectively, located in the eastern and northeastern parts ... Résumé L'étude du système aquifère du Continental Intercalaire du sud tunisien, basée sur l'interprétation des données hydrochimiques (éléments majeurs) et isotopiques (18O, 2H, 13C et 14C), a permis de comprendre le fonctionnement hydrogéologique de ce système aquifère multicouche, largement influencé par la tectonique. La détermination de l'origine de la salinité des eaux de cette nappe, et la compréhension de ses comportements hydrologique et géochimique, ont été approchées par l'étude des corrélations établies entre les éléments majeurs et le résidu sec (RS). L'utilisation des outils isotopiques a montré que l'eau de cette nappe a été rechargée sous un paléoclimat plus froid que l'actuel. Cette technique a permis de mieux comprendre le fonctionnement hydrodynamique de ce système aquifère: elle a fait apparaître l'alimentation relativement récente du système aquifère par infiltration directe d'eau de pluie, à partir respectivement des affleurements carbonatés et sableux du Crétacé et du Miocène, locali...